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中山大学;中山大学附属口腔医院杨博获国家专利权

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龙图腾网获悉中山大学;中山大学附属口腔医院申请的专利一种基于单细胞分析建立的用于评估头颈鳞癌预后的评分系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117116346B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-30发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310988594.0,技术领域涉及:G16B25/10;该发明授权一种基于单细胞分析建立的用于评估头颈鳞癌预后的评分系统是由杨博;关杰中;刘欣雨;王康;王丹设计研发完成,并于2023-08-07向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于单细胞分析建立的用于评估头颈鳞癌预后的评分系统在说明书摘要公布了:本发明提供基于单细胞分析建立的用于评估头颈鳞癌预后的评分系统,包括:获取样本数据,包括头颈鳞癌单细胞数据和大队列RNA数据,大队列RNA数据包括头颈鳞癌患者RNA序列数据和临床信息;对所述单细胞数据和大队列RNA数据进行质量控制;对所述单细胞数据中的细胞进行聚类和注释;定义恶性细胞和代谢活性基因;根据代谢活性将细胞分群;根据分群后的细胞代谢活性与头颈鳞癌的相关性,建立细胞群比例与头颈鳞癌预后的关系;根据评分体系筛选代谢生物标志物。将单细胞测序和RNA‑Seq技术结合从细胞和临床预后层面构建评分系统,利用单细胞测序和肿瘤代谢重编程技术为分析代谢特征以及重编程对肿瘤恶性程度和耐药性影响提供参考。

本发明授权一种基于单细胞分析建立的用于评估头颈鳞癌预后的评分系统在权利要求书中公布了:1.一种基于单细胞分析建立的用于评估头颈鳞癌预后的评分方法,其特征在于,包括:获取样本数据,样本数据包括头颈鳞癌单细胞数据和大队列RNA数据,大队列RNA数据包括头颈鳞癌患者的RNA序列数据和临床信息;对所述单细胞数据和大队列RNA数据进行质量控制;对所述单细胞数据中的细胞进行聚类和注释;定义恶性细胞和代谢活性基因;根据代谢活性将细胞分群;根据分群后的细胞代谢活性与头颈鳞癌的相关性,建立不同细胞群比例与头颈鳞癌预后的关系;根据评分体系筛选代谢生物标志物;对所述单细胞数据进行质量控制具体包括:去除表达基因≤200的细胞及基因表达数≥2500的细胞;去除双细胞;去除表达在少于3个细胞中的基因;去除线粒体基因;合并数据集;对所述单细胞数据中的细胞进行聚类和注释具体包括:对所有细胞进行降维聚类,过滤掉每个亚群中核糖体基因表达超过35%的细胞;寻找每一亚群中的高表达基因,并根据寻找出的高表达基因,特殊表达的基因和已报道过细胞标记基因对每一细胞亚群进行注释;注释后的细胞分为上皮细胞、T细胞、B细胞、浆细胞、单核细胞、肥大细胞、成纤维细胞及恶性细胞等亚群;所述定义恶性细胞包括:取样本数据中的恶性细胞进行降维聚类;根据每一群中恶性细胞的来源进行分类:转移癌样本来源最多的细胞群定义为转移群,原发癌样本来源最多的细胞群定义为原发群,其余从转移癌和原发癌样本来源相当的恶性细胞群定义为混合群;所述根据代谢活性将细胞分群包括:计算代谢活性的截断值;将高于截断值的恶性细胞定义为高代谢活性细胞,低于截断值的恶性细胞定义为低代谢活性细胞;将降维聚类中恶性细胞以外的细胞定义为非恶性细胞;所述定义代谢活性基因包括:筛选转移群细胞和原发群细胞之间的差异基因;对差异基因进行富集分析;将代谢通路中富集的差异基因定义为代谢相关基因;对代谢相关基因进行GSEA分析,将转移细胞群中富集的代谢相关基因定义为代谢活性基因;所述评分体系具体包括:利用反卷积算法根据高代谢活性细胞和低代谢活性细胞的基因表达图谱,计算所有RNA序列数据对应患者的高代谢活性细胞的比例,定义该比例为评分体系。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中山大学;中山大学附属口腔医院,其通讯地址为:510275 广东省广州市海珠区新港西路135号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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