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申请/专利权人：伊卢米纳剑桥有限公司
申请日：2015-10-16
公开（公告）日：2018-04-27
公开（公告）号：CN107969137A
专利技术分类：..分离、制备或纯化DNA或RNA的方法（DNA或RNA的化学制备入C07H21/00；自微生物中或用酶制备非结构多核苷酸入C12P19/34）[2006.01]
专利摘要：本文中提供的实施方案涉及用于制备靶核酸的条形码化DNA片段的固定化文库，鉴定基因组变体，测定靶核酸的接近性信息、定相信息、和甲基化状态的方法和组合物。
专利权项：制备靶核酸的条形码化DNA片段的文库的方法，其包括：a.使靶核酸与多个转座体复合物接触，每个转座体复合物包含：转座子和转座酶，其中所述转座子包含转移链和非转移链，其中所述转座体复合物的至少一个转座子包含衔接头序列，所述衔接头序列能够与互补捕捉序列杂交；b.将所述靶核酸片段化成多个片段，并且将多个转移链插入所述片段的至少一条链的5’端，同时维持所述靶核酸的接近性；c.使所述靶核酸的所述多个片段与多个固体支持物接触，所述多个中的每个固体支持物包含多个固定化寡核苷酸，每个所述寡核苷酸包含互补捕捉序列和第一条形码序列，并且其中来自所述多个固体支持物中的每个固体支持物的所述第一条形码序列不同于来自所述多个固体支持物中的其它固体支持物的所述第一条形码序列；d.将所述条形码序列信息转移至所述靶核酸片段，从而生成双链片段的文库，其中至少一条链是用所述第一条形码在5’加标签的，其中相同靶核酸的至少两个片段接受相同条形码信息。
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