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申请/专利权人：西北农林科技大学
摘要：本发明公开了一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法及其应用：基于实时定量PCR，以秦川牛基因组DNA为模板，利用一对特异性PCR引物扩增牛FGF13基因的拷贝数变异区域，同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛通用转录因子3基因作为对照，最后利用2‑ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立秦川牛FGF13基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础，有利于加快秦川牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单，快速，便于推广应用。
主权项：1.一种检测秦川牛FGF13基因拷贝数变异的方法，其特征在于：包括以下步骤：以秦川牛基因组DNA为模板，以引物对P1以及引物对P2为引物，分别通过实时定量PCR扩增FGF13基因的拷贝数变异区域以及作为对照的BTF3基因的部分片段，然后根据定量结果鉴定秦川牛FGF13基因的拷贝数变异类型；具有插入型拷贝数变异类型的个体在生长性状上显著优于具有正常型拷贝数变异类型的个体；所述的FGF13基因的拷贝数变异区域位于FGF13基因参考基因组序列AC_000187.1的621003位至622778位；所述的拷贝数变异类型是根据-ΔΔCt将定量结果分为的三类：插入型，-ΔΔCt0.5；缺失型，-ΔΔCt-0.5；正常型，-0.5≤-ΔΔCt≤0.5；所述的引物对P1为：上游引物F1：5’-AAGAGGGTGTTTGCTAT-3’下游引物R1：5’-CAGTAACGCTGAAGAAG-3’；所述的引物对P2为：上游引物F2：5’-AACCAGGAGAAACTCGCCAA-3’下游引物R2：5’-TTCGGTGAAATGCCCTCTCG-3’。
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