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申请/专利权人：齐默尔根公司
摘要：本发明涉及利用HTP基因组工程平台对微生物菌株的改良。本发明提供一种用计算机驱动且整合分子生物学、自动化和先进机器学习方案的HTP微生物基因组工程平台。所述整合平台使用一套HTP分子工具集创建HTP基因设计文库，所述基因设计文库尤其利用科学见解和迭代模式识别得到。本文所述的HTP基因组工程平台是微生物菌株宿主不可知的且因此能够跨越分类群建构。另外，所揭示的平台能够建构成调节或改良所关注的任何微生物宿主参数。
主权项：1.一种迭代式改良候选微生物菌株设计的计算机实施方法，所述方法包含：a.访问用训练集填充的预测模型，所述训练集包含代表了相对于一或多种背景微生物菌株的基因变化的输入以及相应性能度量，其中用训练集填充预测模型是指基于所述训练集开发所述预测模型；b.将测试输入应用于代表基因变化的所述预测模型，所述测试输入对应于并入所述基因变化的候选微生物菌株；c.至少部分地基于所述预测模型来预测所述候选微生物菌株的表型性能；d.至少部分地基于所述候选微生物菌株的预测性能来选择所述候选微生物菌株的第一子集；e.获得所述候选微生物菌株的所述第一子集的实测表型性能；f.至少部分地基于所述候选微生物菌株的所述第一子集的所述实测表型性能实现所述候选微生物菌株的第二子集的选择；g.向所述预测模型的所述训练集中添加1对应于候选微生物菌株的所选第二子集的输入以及2候选微生物菌株的所选第二子集的相应实测性能；以及h.重复步骤b-g。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 齐默尔根公司 利用HTP基因组工程平台对微生物菌株的改良
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