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申请/专利权人:株式会社益力多本社;学校法人近畿大学
摘要:在第IV期的大肠癌的治疗中,使用FOLFOX疗法或FOLFIRI疗法的任一种的全身化学疗法。但是,没有方法来预料哪一种疗法对于各患者是有效的。一种生物标志,其表明选择针对大肠癌的FOLFOX治疗和FOLFIRI治疗中的哪一种疗法对患者是有利的,其特征是上述生物标志是人染色体上的7p15.3、7q34、8q24.1、8q24.2、8q24.1‑q24.2、9q34.3、13q12.2、13q14.11、13q22.1、13q32.2‑q32.3、13q34、20q12、20q13.13、20q13.2、20q13.3中的至少1个区域的拷贝数有无增加,通过使用该生物标志,可以判断选择FOLFIRI疗法或FOLFOX疗法的哪一种是更加有利的。
主权项:1.测定所述大肠癌的肿瘤组织试样的人染色体上的特定区域的拷贝数有无增加的试剂在制造试剂盒中的用途,所述试剂盒用于针对大肠癌选择FOLFOX疗法或FOLFIRI疗法,其中,选择疗法包括:测定所述大肠癌的肿瘤组织试样的人染色体上的特定区域的拷贝数有无增加的工序,及根据所述拷贝数有无增加来选择所述FOLFOX疗法或FOLFIRI疗法的工序,其特征在于,所述人染色体上的特定区域是7q34,选择所述FOLFOX疗法或FOLFIRI疗法的工序是在所述特定区域的拷贝数增加的情况下选择FOLFIRI疗法。
全文数据:治疗方法的选择方法以及表明该选择方法的生物标志技术领域[0001]本发明涉及生物标志和使用该生物标志的疗法的选择方法,上述生物标志表明针对大肠癌选择FOLFOX疗法和F0LFIRI疗法中的哪一种对患者是有利的。背景技术[0002]在大肠癌研究会的大肠癌治疗指南中,大肠癌用五个阶段分期表示进展程度。随着分期的发展,癌的进展程度发展。该分期的判断通过向大肠壁的浸润度、有无向淋巴结的转移、有无向其他脏器的转移进行判断。第IV期是最严重恶化的大肠癌,是确认到向其他脏器的转移的阶段。在这样的分期中,难以进行外科切除,主要实施全身化学疗法。[0003]作为针对该浸润和转移性结肠直肠癌的治疗,在一线用药中广泛推荐FOLFOX疗法+贝伐单抗Bevacizumab、或F0LFIRI疗法+贝伐单抗。其中,贝伐单抗BEV是作为针对VEGF-AvascularendothelialgrowthfactorA:血管内皮生长因子A的人源化单克隆抗体而开发的、抑制VEGF-VEGFR结合的药物。肿瘤血管的血管内皮细胞通过暴露于药物而阻断VEGFRVascularEndothelialGrowthFactorReceptor:血管内皮细胞生长因子受体信号传导,结果是肿瘤血管受到强大的血管新生抑制作用。[0004]已确立BEV对无法切除和复发结肠直肠癌的有用性,且出现在临床上已经过多年。BEV的药理作用机理在开发新药时是明确的,从早期的临床开发阶段就投入精力进行对包括BEV在内的血管新生抑制药的生物标志的研究。但是,目前尚未特定在临床实践上具有有用的重现性、简便、测定值在设施间没有差别、非浸润性的生物标志。[0005]同样地,对于F0LF0X5-氟尿嘧啶(5-FU左亚叶酸钙(I-LV+奥沙利铂(L-OHP疗法及F0LFIRI5-氟尿嘧啶5-FU左亚叶酸钙(I-LV+伊立替康CPT-11疗法这两种治疗方案的效果预测因子,目前尚未确定已证明在临床实践上有用的生物标志。[0006]将DNA的拷贝数作为能用于选择对发病的患者的最佳药物治疗方法的标志,已知专利文献1日本专利特开2011-135838号公报)。其能以高精度和概率预测导致明显视力下降的年龄相关性黄斑变性症的发病和进展,提供能适合用于年龄相关性黄斑变性症的早期预防、或选择针对已发病的患者的最佳的药物治疗方法的用于判定年龄相关性黄斑变性症感受性的标志。[0007]作为针对大肠癌使用DNA拷贝数作为标志的例子,有专利文献2日本专利特开2010-162029号公报)。这里,提供一种将两种非常不同类型的阵列组合,以高分辨率迅速且正确地检测出能成为癌和三体综合征等各种各样的遗传缺陷的标志的基因拷贝数的变化的方法。在该方法中,作为成为对象的疾病,可例举乳腺癌、肺癌、大肠癌、睾丸癌、子宫内膜癌或膀胱癌。[0008]此外,在专利文献3日本专利特表2008-524986号公报)中,公开了将基因拷贝数的变化用在乳腺癌、卵巢癌、胃癌、大肠癌、食道癌、间质癌、膀胱癌或非小细胞肺癌的诊断、预后、预测、预防和治疗的方法,更具体而言,想要通过基因拷贝数的变化来进行针对包含Taxol商标或Taxotere商标等紫杉烧或其他基于紫杉烧的衍生物的各种治疗计划的肿瘤性病变的响应预测。[0009]现有技术文献[0010]专利文献[0011]专利文献1:日本专利特开2011-135838号公报[0012]专利文献2:日本专利特开2010-162029号公报[0013]专利文献3:日本专利特表2008-524986号公报发明内容[0014]本发明所要解决的技术问题[0015]如专利文献3中所公开,关于在针对癌的治疗方法的响应预测中采用基因拷贝数的增加的方面,已被公开了。但是,没有具体地公开用于判断选择针对大肠癌的FOLFOX疗法和F0LFIRI疗法的哪一种对各患者是有利的标志。[0016]通常认为这些疗法不存在交叉耐药性,当一种药物疗法没有效果时,可进行另一种的药物疗法。但是,在一种药物疗法没有效果后再进行另一种的药物疗法,需要更大的对副作用的忍受性,从该方面及治疗成本的方面考虑,对患者而言,会成为大的负担。[0017]大肠癌的患者数仅在日本国内就超过10万人,今后对于FOLFOX疗法和F0LFIRI疗法确定抗肿瘤药的效果预测因子,进行治疗对象的分层,从医疗经济方面来看是有益的。此夕卜,不仅在医疗经济方面,对于患者而言,还可带来以下有益性:避免因投给无效的药物而引起的有害事件的出现及由无效药物造成的无用的治疗期间等。因此,预测FOLFOX疗法和F0LFIRI疗法中的哪一种方法对该患者有利的必要性较高。[0018]解决技术问题所采用的技术方案[0019]本发明是鉴于上述技术问题而想到的,提供一种根据人染色体上的特定区域的拷贝数有无增加,表明进行FOLFOX疗法或F0LFIRI疗法对该患者是有利的生物标志和治疗方法的选择方法。[0020]更具体而言,本发明的生物标志是在针对大肠癌进行FOLFOX疗法或F0LFIRI疗法时,表明对患者而言哪一种疗法是有利的生物标志,其特征是,[0021]上述生物标志是人染色体上的7pl5.3、7q34、8q24.I、8q24.2、8q24.I_q24.2、9q34.3、13ql2.2、13ql4.11、13q22.I、13q32.2_q32.3、13q34、20ql2、20ql3.13、20ql3.2、20ql3.3中的至少I个区域的拷贝数有无增加。[0022]此外,本发明是在针对大肠癌进行FOLFOX疗法或F0LFIRI疗法时,表明哪一种疗法对患者是有利的生物标志,其特征是,[0023]上述生物标志是人染色体上的7q34、8q24.I、8q24.2、8q24.I_q24.2、9q34.3、13q12.2、13q14.11中的任一个区域的拷贝数有无增加。[0024]此外,本发明的治疗方法的选择方法是针对大肠癌选择FOLFOX疗法或F0LFIRI疗法中的任一种疗法的选择方法,其特征是,包括:[0025]测定上述大肠癌的肿瘤组织试样的人染色体上的特定区域的拷贝数有无增加的工序,及[0026]根据上述拷贝数有无增加来选择上述FOLFOX疗法或F0LFIRI疗法的工序,[0027]上述人染色体上的特定区域是7pl5.3、7q34、8q24.1、8q24.2、8q24.1-q24.2、9q34.3、13ql2.2、13ql4.11、13q22.I、13q32.2-q32.3、13q34、20ql2、20ql3.13、20ql3.2、20ql3.3中的至少I个区域。[0028]此外,本发明的治疗方法的选择方法的特征是,上述人染色体上的特定区域是7q34、8q24.I、8q24.2、8q24.I_q24.2、13ql2.2、13ql4.11中的至少1个区域,选择上述FOLFOX疗法或F0LFIRI疗法的工序是在上述特定区域的拷贝数增加的情况下选择F0LFIRI疗法。[0029]此外,本发明的治疗方法的选择方法的特征是,上述人染色体上的特定区域是9q34.3区域,选择上述FOLFOX疗法或F0LFIRI疗法的工序是在上述特定区域的拷贝数无增加的情况下选择F0LFIRI疗法。[0030]此外,本发明的治疗方法的选择方法的特征是,上述人染色体上的特定区域是7pl5.3和8q24.1,选择上述FOLFOX疗法或F0LFIRI疗法的工序是在上述7ql5.3中确认到拷贝数的增加,且在上述8q24.1中未确认到拷贝数的增加的情况下,选择FOLFOX疗法。[0031]发明效果[0032]根据本发明的生物标志及治疗方法的选择方法,对于作为统计的效果大致相等的FOLFOX疗法及F0LFIRI疗法,可选择对各患者而言哪一种疗法是否是有利的。因此,对于患者而言,可起到在接受一种疗法后,没有必要再做另一种疗法的效果。[0033]附图的简要说明[0034]图1是显不利用安捷伦科技公司的genomicWorkbench6.5Lite软件的染色体全部区域和在该区域中编码的基因的列出的例子的图。[0035]图2是显示在第7号、第8号、第13号、第20号染色体中具有扩增区域的部分的图。[0036]图3是显示基于第7号染色体长臂347q34的区域中的拷贝数有无增加的生存率曲线的图[0037]图4是显示对于第7号染色体长臂中具有的共4个扩增区域,基于拷贝数有无增加的生存率曲线的图。[0038]图5是显示对于第13号染色体长臂中具有的共5个扩增区域,基于拷贝数有无增加的生存率曲线的图。[0039]图6是显示对于第20号染色体长臂中具有的共4个扩增区域,基于拷贝数有无增加的生存率曲线的图。[0040]图7是显示对于第7号、第13号、第20号中具有的扩增区域的ETS的结果的图。[0041]图8是对于在0S、ETS双方确认到显著差异的7q34的区域,划分为⑴FOLFOX疗法+贝伐单抗的FOLFOX组75例、(2F0LFIRI疗法+贝伐单抗的F0LFIRI组79例,(logrank:对数秩检验各自有扩增的病例、无扩增的病例之间的0S,共计4组进行了比较的结果卡普兰_迈耶曲线)。[0042]图9是显示第13号染色体中的结果Kaplan-Meyer曲线)的图。[0043]图10是显示第13号染色体中的结果Kaplan-Meyer曲线)的图。[0044]图11是显示第20号染色体中的结果Kaplan-Meyer曲线)的图。[0045]图12是显示第20号染色体中的结果Kaplan-Meyer曲线)的图。[0046]图13是显示第7号染色体区域中的全部患者(154名)的拷贝数有增加CNG、无增加之间的〇S、PFS中的差异以及有CNG+、无CNG㈠的两组中的FOLFOX组、F0LFIRI组之间的OS、PFS中的差异p值的图。[0047]图14是显示第8号染色体区域中的全部患者(154名)的拷贝数有增加CNG、无增加之间的〇S、PFS中的差异以及有CNG+、无CNG㈠的两组中的FOLFOX组、F0LFIRI组之间的OS、PFS中的差异p值的图。[0048]图15是显示第13号、第20号染色体区域中的全部患者(154名)的拷贝数有增加CNG、无增加之间的0S、PFS中的差异以及有CNG+、无CNG-的两组中的FOLFOX组、F0LFIRI组之间的0S、PFS中的差异p值)的图。[0049]图16是显示7pl5.3的区域中的PFS的卡普兰-迈耶曲线的图。[0050]图17是显示8q24.1的区域中的OS的卡普兰-迈耶曲线的图。[0051]图18是显示8q24.1的区域中的PFS的卡普兰-迈耶曲线的图。[0052]图19是显示基于7pl5.3和8q24.1的区域中的CNG的状况进行分组后的PFS和OS的卡普兰-迈耶曲线的图。[0053]图20是显示基于7pl5.3和8q24.1的区域中的CNG的状况进行分组后的PFS和OS的卡普兰-迈耶曲线的图。[0054]图21是显示第7号、第8号、第13号、第20号以外的染色体扩增区域中的全部患者154名)、F0LF0X组75名)、F0LFIRI组79名)的拷贝数有增加、无增加之间的0S、PFS中的差异P值的图。[0055]图22是显示9q34.3区域的F0LF0X组、F0LFIRI组中的拷贝数有增加、无增加之间以及有CNG+、无CNG㈠的两组中的F0LF0X组、F0LFIRI组之间的卡普兰-迈耶曲线的图。具体实施方式[0056]以下,对本发明的生物标志和治疗方法的选择方法,示出附图和实施例进行说明。另外,以下的说明是对本发明的一种实施方式和一个实施例进行例示,本发明并不限定于以下的说明。以下的说明可在不脱离本发明的思想的范围内进行改变。[0057]在第IV期中使用的化学疗法中,使用F0LF0X疗法和F0LFIRI疗法。F0LF0X疗法是指联用氟尿嘧啶5-氟尿嘧啶5-FU、亚叶酸左亚叶酸钙(I-LV和奥沙利铂oxaliplatinL-OHP这三种药物的治疗方法。在F0LF0X疗法中还可以包括联用贝伐单抗bevacizumabBEV〇[0058]F0LFIRI疗法是指联用氟尿嘧啶(5-氟尿嘧啶(5-FU、亚叶酸(左亚叶酸钙(I-LV和伊立替康盐酸盐(irinotecanCPT-Il以下简称为“伊立替康”)这三种药物的治疗方法。在F0LFIRI疗法中还可以包括联用贝伐单抗bevacizumabBEV。[0059]因此,F0LF0X疗法和F0LFIRI疗法的不同点是奥沙利铂和伊立替康的不同。但是,以往未能预测对于各个患者适合采用哪一种疗法。如以下的实施例所示,本发明中,在各患者的肿瘤组织试样中的染色体中,通过考察人染色体上的特定区域的拷贝数有无增加,能够判断选择哪一种疗法是有利的。[0060]这里,“有利的”是指能以高概率期待治疗后的生存期变长。此外,这里,人染色体上的特定区域的拷贝数有无增加可以通过后述的CGH法、PCR法、RT-PCR法等方法进行测定。[0061]实施例[0062]实施例1[0063]以下的实施例涉及使用的对象症例是符合无法切除和复发结肠直肠癌初次化学疗法例,自2008年9月到2012年12月为止登记在西日本癌研究机构WestJapanOncologyGroup的“针对无法切除和复发结肠直肠癌初次化学疗法例的5-氟尿嘧啶5-FU左亚叶酸钙(I-LV+奥沙利铂L-OHP+贝伐单抗BEV联用疗法与5FUI-LI+伊立替康CPT-Il+BEV联用疗法的随机化比较第III期试验WJ0G4407G”中,且获得WJ0G4407GTR同意的患者的数据。[0064]作为试样,使用由治疗前获得的肿瘤组织试样制作的病理玻片FFPE玻片)。肿瘤组织试样是手术试样或者内视镜下的活组织,玻片是经过石蜡包埋、使用5微米的切片的薄切,固定在载玻片上而制作的玻片。因此,手术时采集试样或利用内视镜采集活组织可以称为采集肿瘤组织试样的工序。另外,也可以使用在临床试验登记以前采集的试样。[0065]肿瘤组织中的人染色体上的特定区域的拷贝数变化通过使用比较基因组杂交ComparativeGenomicHybridizationCGH法进行了测定。CGH法是将全部染色体作为对象,在短时间内检测出基因组DNA的过剩、缺失、扩增等拷贝数异常的方法。因为能检测出染色体拷贝数的变化,所以作为在现有的染色体分析法中难以详细解析的固体肿瘤的基因组异常分析法,现在被广泛利用。[0066]虽然能确定以染色体级别的物理尺寸发生的拷贝数的减少(loss、增加gain、扩增amplification,但是根据本技术不能检测出无伴随拷贝数的变化的染色体平衡易位。例如,如易位那样的染色体本身的数量不发生变化的情况等。[0067]由于预想最新鉴定的扩增区域所包含的癌相关基因随基因扩增其表达量也增加,所以以探索成为新癌治疗靶的基因为目的,频繁地进行CGH分析。在本研究中,使用自石蜡切片提取的基因组DNA,通过使其与市售的来源于正常组织的DNA竞争来进行分析。[0068]CGH分析的步骤如下所述。[0069]首先,进行从FFPE试样提取DNA。进行了全部154个试样的DNA的提取。[0070]接着,对从癌部提取的DNA进行荧光标记和杂交的准备。具体而言,癌部DNA用花菁5Cy5进行荧光标记,参比DNA来源于正常组织的DNA用花菁3Cy3进行荧光标记。[0071]如下进行杂交。将处理完成的IlOul样品(Cy5标记化癌部DNA+Cy3标记化参比DNA中的IOOul涂覆在与安捷伦科技公司的CGH微阵列4X44K对应的垫片载玻片上。接着,以与4X44K微阵列载玻片中的探针的涂覆面接触的方式,使两玻片重叠后,固定于腔中。在旋转式炉中,在65°C下进行了40小时的杂交反应。[0072]实际的分析通过以下步骤来进行。首先,在两块重叠的垫片玻片和阵列玻片之间插入镊子,将其剥开。将阵列玻片插入盛满了安捷伦科技公司的CGH清洗用缓冲液1的玻璃容器中的玻片架中。然后在室温下放置了5分钟。[0073]接着,将阵列与玻片架一起转移到盛满了安捷伦科技公司的CGH清洗用清洗缓冲液2的其他玻璃容器中。然后在37°C下放置了1分钟。[0074]接着,将阵列取出,固定在玻片支架上。接着,固定在安捷伦科技公司的带有除臭氧滤器的扫描器上,进行了扫描。[0075]在PC电脑上安装安捷伦科技公司的扫描器控制软件,读取阵列的图像。[0076]接着,使用安捷伦科技公司的Featureextraction软件,从之前读取的图像中,对于在阵列上结合了各个探针的点(约44000处获得Cy3、Cy5的荧光强度。计算出Cy5Cy3的l〇g2比值,估算了各点(第〇号染色体的〇基因座)中的人染色体上的特定区域的拷贝数有无增加。[0077]将人染色体上的特定区域的拷贝数有无增加称为畸变aberration。使用安捷伦科技公司的genomicWorkbench6.5Lite软件对在第几号染色体的哪一区域存在畸变进行了分析。图1a图示了各染色体的全部区域和图1b列出了各染色体上的区域中所编码的基因的表是例示了该软件弹出的内容的图。基于该数据,可知道各症例的全部染色体中的畸变。[0078]对于图1的表(图1b,输出了样品名、染色体编号、基因座、扩增或缺失、该基因座中所包含的基因名等信息。本实施例中,在全部154个试样的所有试样中,记录了确认畸变的染色体及其基因座。本研究特别是仅对Cy5Cy3的log2比0.25,即与正常相比确认到扩增2〇1=1.19倍以上的基因座进行了探索。这样与正常组织比较来算出拷贝数的增减,可以称为测定大肠癌的肿瘤组织试样的人染色体上的特定区域的拷贝数有无增减的工序。[0079]另外,像扩增为1.19倍这样,而没有达到整数倍,这是因为假定了正常细胞的混入或肿瘤细胞的不均匀性等收集DNA的肿瘤组织中的细胞的异质性heterogeneity。[0080]此外,对于大部分的人基因,也可以使用能简便地进行所有组织中的基因拷贝数的测定的生命技术公司的“Taqman注册商标)拷贝数测定CopyNumberAssay’’。[0081]对于从成为此次(IF0LF0X疗法+贝伐单抗、(2F0LFIRI疗法+贝伐单抗两者联用疗法的对象的154名大肠癌患者的治疗前的手术试样、或者活组织标本(内视镜下活组织)的石蜡包埋切片提取的癌部基因组DNA,使用安捷伦科技公司的试剂盒“安捷伦寡核苷酸CGH微阵列试剂盒AgilentOligoCGHMicroarrayKit”进行了CGH分析。另外,各患者的观察期为1600天。[0082]将人染色体上的特定区域的拷贝数增加的截断值设定为log2比0.25,对扩增为原来的约1.2倍以上,S卩2.4拷贝数以上的区域进行了探索。于是,在第7号、第8号、第13号、第20号染色体中具有扩增的症例集中。在表1中示出30症例以上显示扩增的区域。[0083][表1][0084][0085]~表1中,“Chr”表示染色体编号,“locus”表示基因座。对于这些各区域,在拷贝数有增加的症例(患者)、拷贝数无增加的症例(患者这两组之间进行了PFSProgression-freesurvival:无进展生存期和OSOverallSurvival:总生存期)的对数秩检验。其结果是,在任何区域中都没有确认到PFS存在显著差异。但是,在除第8号染色体以外的所有区域中,都确认到OS存在显著差异p0.25,对扩增为原来的约1.2倍以上,S卩2.4拷贝数以上的区域进行了探索。于是,在第7号、第8号长臂、第13号、第20号染色体中具有扩增的症例集中。在第7号、第8号、第13号、第20号染色体中的扩增区域如图2所示。[0123]在图13第7号)、图14第8号)、图15第13号、第20号)中显示制成表的以染色体带划分的这些各染色体区域中的全部患者(154名)、F0LF0X疗法组75名)、F0LFIRI疗法组79名)的拷贝数有增加CNG:CopyNumberGain、拷贝数无增加之间的0S、PFS中的差异p值)以及有CNG+、无CNG㈠的两组中的FOLFOX疗法组、F0LFIRI疗法组之间的0S、PFS中的差异P值。[0124]对于这些各区域,若在全部患者(154名)中的人染色体上的特定区域的拷贝数有扩增的症例(患者)、无扩增的症例(患者)的两组之间进行PFS无进展生存期和OS总生存期)的对数秩检验,则在任一区域中都没有确认到PFS存在显著差异。但是,在第7q号、第13q号、第20号染色体的多个区域中确认到了OS存在显著差异参照图13、14、15的“总计(154”栏的“0S”)。即,p值小于0.05p0.05。这样的OS具有显著差异的基因扩增区域暗示可能包含预后制约因子。[0125]若参照图13,则在第7号染色体短臂7p的大部分区域中的CNG-组中,观察到PFS存在准显著差异(日文:準有意疔差)(p0.1。其中,将P值最小的7pl5.3的区域中的PFS的卡普兰-迈耶曲线示于图16中。[0126]图16a与FOLFOX疗法相关,是关于有增加CNG⑴)、无增加CNG-的图。图16b与F0LFIRI疗法相关,是关于有增加CNG+、无增加CNG-的图。图16C与有增加CNG+相关,是关于FOLFOX疗法和F0LFIRI疗法的图。此外,图16d与无增加CNG㈠)相关,是关于FOLFOX疗法和F0LFIRI疗法的图。[0127]关于全部的图,横轴是观察期记为“时间(月”),纵轴是关于PFS的生存概率记为“PFS概率”)。另外,各图横轴记载了从0到70个月)的刻度,纵轴记载了从0到1的刻度。[0128]若参照图16,则在图16d中可观察到p值为0.059的准显著差异。即,在该区域中基因没有扩增的患者中,可以说F0LFIRI疗法显示出比FOLFOX疗法高的治疗效果。[0129]接着,参照图14。在从第8号染色体长臂24.1到24.28q24.1_q24.2,可观察到CNG⑴组中的PFS存在显著差异p=0.037或准显著差异p=0.053。在图17中显示8q24.1中的OS的卡普兰-迈耶曲线,在图18中显示PFS。[0130]在各图中,横轴是观察期(记为“时间(月)”),纵轴是生存概率记为“0S或PFS概率”),与图16的情况相同。此外,在各图中,(a与FOLFOX疗法相关,是关于有增加CNG+、无增加CNG-的图;(b与F0LFIRI疗法相关,是关于有增加CNG+、无增加CNG㈠)的图;(c与有增加CNG⑴相关,是关于FOLFOX疗法和F0LFIRI疗法的图;此外,⑷与无增加CNG㈠)相关,是关于FOLFOX疗法和F0LFIRI疗法的图,也与图16相同。另外,各图横轴记载了从0到70个月)的刻度,纵轴记载了从0到1的刻度。[0131]参照图17a、图17b,在FOLFOX疗法组中,CNG㈠中OS显著变长;在F0LFIRI疗法组中,CNG⑴中OS显著变长各自的p值都小于0.05。此外,在CNG⑴组参照图17c中,F0LFIRI疗法组与F0LF0X疗法组相比,预后更加良好p=0.004。[0132]参照图18。反映图17的结果,在PFS中,在CNG+组参照图18c中,FOLFIRI疗法组与F0LF0X疗法组相比,治疗效果也是显著地较高p=0.037。[0133]在图19、图20中显示根据7pl5.3和8q24.1中的CNG的状况分组的4组中的PFS和OS的卡普兰-迈耶曲线。图19a、图19b是7pl5.3和8q24.1的CNG均有增加CNG+的情况。图19a是关于PFS的曲线,图19b是关于OS的曲线。[0134]图19c、图19d是7pl5·3的CNG有增加CNG+,8q24.1的CNG无增加CNG_的情况。图19c是关于PFS的曲线,图19d是关于OS的曲线。[0135]图20a、图20b是7ρ15·3的CNG无增加(CNG㈠),8q24.1的CNG有增加(CNG+的情况。图20a是关于PFS的曲线,图20b是关于OS的曲线。[0136]图20c、图20d是7ρ15·3和8q24.1的CNG均无增加(CNG㈠)的情况。图20c是关于PFS的曲线,图20d是关于OS的曲线。[0137]此外,在各图中,横轴是观察期(记为“时间(月)”),纵轴是生存概率记为“0S或PFS概率”)。另外,各图横轴记载了从0到70个月)的刻度,纵轴记载了从0到1的刻度。[0138]在7ρ15·3中的CNG-、8q24.1中的CNG+的情况下卿CNG_、+:参照图20a、b,显示了在F0LFIRI疗法组中治疗效果有较大的优势。[0139]在〇如+、+图19、〇3和0如+、-图193、(1的情况下,根据05的卡普兰-迈耶曲线(图19b和d,分别暗示了F0LFIRI疗法、FOLFOX疗法的有利性。[0140]S卩,图19a、(b中,如果在7pl5.3和8q24.1的各区域中均确认到基因拷贝数的增加,则暗示F0LFIRI疗法是有利的。此外,图19C、(d中,如果在7pl5.3中基因有增加,在8q24.1中基因无增加,则暗示FOLFOX疗法是有利的。[0141]接着,再参照图14。在从8q24.1到8q24.2区域确认CNG有增加的症例中,NSMMCE2、TRBI、FAM84B、P0U5F1B、L0C727677、MYC、PVT1是最频繁地共同显示CNG有增加(确认到拷贝数增加)的基因组。根据以上所述,暗示了在该区域内可能包含提高F0LFIRI疗法的效果的因子。[0142]如果发现了提高F0LFIRI伊立替康疗法的感受性的基因A,则对于各个浸润和转移性结肠直肠癌的患者,通过预测基因A的拷贝数,如果确认到增加,就能积极地选择F0LFIRI疗法和贝伐单抗的联用治疗。[0143]此外,参照图13,在包含7pl5.3的7p全部区域中,有可能包含提高FOLFOX疗法的效果的因子。[0144]在图21中显示第7号、第8号、第13号、第20号以外的染色体扩增区域中的全部患者154名)、F0LF0X组75名)、F0LFIRI组79名)的拷贝数有增加、无增加之间的0S、PFS中的差异P值)。[0145]其中,在图22中显示在PFS中确认到特别低的值0.11的9q34.3区域的FOLFOX疗法组、F0LFIRI疗法组中的拷贝数有增加、无增加之间以及有CNG+、无CNG㈠这两组中的FOLFOX疗法组、F0LFIRI疗法组之间的卡普兰-迈耶曲线。[0146]图22a与FOLFOX疗法相关,是关于有增加CNG+、无增加CNG-的图。图22b与F0LFIRI疗法相关,是关于有增加CNG+、无增加CNG-的图。图22C与有增加CNG+相关,是关于FOLFOX疗法和F0LFIRI疗法的图。此外,图22d与无增加CNG㈠)相关,是关于FOLFOX疗法和F0LFIRI疗法的图。[0147]关于全部的图,横轴是观察期(记为“时间(月)”),纵轴是关于PFS的生存概率记为“PFS概率”)。另外,各图横轴记载了从0到70个月)的刻度,纵轴记载了从0到1的刻度。[0148]若参照图22d,则在全部154症例中,在该区域内拷贝数无增加的137例中,F0LFIRI疗法的治疗效果是显著良好。[0149]在9q34.3区域内确认CNG有增加的患者中,最频繁地共同显示CNG有增加的基因组是NOTCHl、EGFL7、MIR126、AGPAT2、FAM69B、SNHG7。它们之中,有可能包含提高FOLFOX疗法的治疗效果、或降低F0LFIRI疗法的治疗效果的因子。[0150]如果发现了这样的因子B,则对于各个浸润和转移性结肠直肠癌的患者,通过测定基因B的拷贝数,对于未发现有基因B的拷贝数的增加的患者,可以优先选择F0LFIRI伊立替康疗法作为贝伐单抗的联用疗法。当然,即使没有确定这样的基因B,如果9q34.3区域的CNG没有增加,则可以优先选择F0LFIRI伊立替康疗法作为贝伐单抗的联用疗法。[0151]根据以上所述,作为将两种联用疗法的效果区别的生物标志候选,可例举在8924.1124.2、9934.3这两处的扩增区域内所含的基因,通过考察8924.1124.2、9934.3这两处的扩增区域的拷贝数有无增加,可以进行联用治疗的选择。[0152]更具体而言,在8q24.1_q24.2的扩增区域内基因有扩增的情况下,选择F0LFIRI疗法作为贝伐单抗的联用疗法即可。另外,8q24.1-q24.2的增加区域包括仅在8q24.1区域内或仅在8q24.2区域内基因的拷贝数有增加的情况。此外,在9q34.3扩增区域内基因无扩增的情况下,选择F0LFIRI疗法作为贝伐单抗的联用疗法即可。[0153]产业上利用的可能性[0154]本发明的生物标志适合在判断选择FOLFOX疗法和F0LFIRI疗法中的哪一种作为大肠癌的治疗方法时使用。
权利要求:1.一种生物标志,其为在针对大肠癌进行FOLFOX疗法或FOLFIRI疗法时,表明哪一种疗法对患者是有利的生物标志,其特征在于,所述生物标志是人染色体上的7pl5.3、7q34、8q24.1、8q24.2、8q24.1-q24.2、9q34.3、13ql2.2、13ql4.11、13q22.1、13q32.2_q32.3、13q34、20ql2、20ql3.13、20ql3.2、20ql3.3*的至少1个区域的拷贝数有无增加。2.—种生物标志,其为在针对大肠癌进行FOLFOX疗法或FOLFIRI疗法时,表明哪一种疗法对患者是有利的生物标志,其特征在于,所述生物标志是人染色体上的7q34、8q24·I、8q24·2、8q24·l_q24·2、9q34·3、13ql2·2、13ql4.11中的任一个区域的拷贝数有无增加。3.—种治疗方法的选择方法,其为针对大肠癌选择FOLFOX疗法或FOLFIRI疗法中的任一种疗法,其特征在于,包括:测定所述大肠癌的肿瘤组织试样的人染色体上的特定区域的拷贝数有无增加的工序,及根据所述拷贝数有无增加来选择所述FOLFOX疗法或FOLFIRI疗法的工序,所述人染色体上的特定区域是7pl5.3、7q34、8q24.1、8q24.2、8q24.1_q24.2、9q34.3、13ql2.2、13ql4.11、13q22.1、13q32.2_q32.3、13q34、20ql2、20ql3.13、20ql3.2、20ql3.3*的至少1个区域。4.如权利要求3所述的治疗方法的选择方法,其特征在于,所述人染色体上的特定区域是7934、8924.1、8924.2、8924.1124.2、13912.2、13914.11中的至少1个区域,选择所述FOLFOX疗法或FOLFIRI疗法的工序是在所述特定区域的拷贝数增加的情况下选择FOLFIRI疗法。5.如权利要求3所述的治疗方法的选择方法,其特征在于,所述人染色体上的特定区域是9q34.3区域,选择所述FOLFOX疗法或FOLFIRI疗法的工序是在所述特定区域的拷贝数无增加的情况下选择FOLFIRI疗法。6.如权利要求3所述的治疗方法的选择方法,其特征在于,所述人染色体上的特定区域是7pl5.3和8q24.1,选择所述F0LF0X疗法或FOLFIRI疗法的工序是在所述7ql5.3中确认到拷贝数的增加,且在所述8q24.1中未确认到拷贝数的增加的情况下,选择F0LF0X疗法。
百度查询: 株式会社益力多本社 学校法人近畿大学 治疗方法的选择方法以及表明该选择方法的生物标志
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