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摘要：本发明涉及计算机辅助药物研发技术领域，具体涉及一种在mRNA密码子优化的DFA图中实现Motif序列约束的方法，该方法包括步骤A：在DFA图中定位Motif子图的位置；步骤B：对局部的DFA图进行扩展；步骤C：删除独立出来Motif子图；步骤D：重复执行步骤A，直至Motif子图完全删除。本发明避免了显式地对候选密码子进行排列组合，而是将约束隐含在DFA图的路径之中，在优化开始前对DFA图进行处理，从而避免了密码子排列组合所需的大量后期处理的计算量。由此，该方法解决了在mRNA密码子优化中Motif序列的约束问题，为长序列的mRNA密码子设计提供了有效的解决手段。
主权项：1.一种在mRNA密码子优化的DFA图中实现Motif序列约束的方法，其特征在于：包括以下步骤：步骤A、在DFA图中定位Motif子图的位置，以获得Motif子图所属的边的序列；步骤B、对局部的DFA图进行扩展，将Motif子图与其余部分进行分离；步骤C、删除独立出来Motif子图，即在DFA图中删除相应的边和游离的顶点；步骤D、重复以上步骤，直至Motif子图完全删除。
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百度查询： 北京中大唯信科技有限公司 一种在mRNA密码子优化的DFA图中实现Motif序列约束的方法
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