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申请/专利权人：杭州联川生物技术股份有限公司
摘要：本发明公开了一种m6A测序的peak功能元件注释的方法、系统、设备和介质，属于m6A测序技术领域。所述方法包括以下步骤：获得目标物种的m6A测序结果，并利用call‑peak软件得到peak信息；获得目标物种的基因组，并获得蛋白编码类型的转录本注释信息，包括基因信息、各功能元件的区间位置信息和相对于基因组的正负链信息；将所述peak信息与所述转录本注释信息进行比对，获得每一个peak的功能元件注释结果。本发明提供了更符合m6A研究相关的注释结果，并且提供了更加精准，信息更加全面的注释信息，更利于下游关于m6ARNA甲基化修饰相关作用机制和功能研究的开展。
主权项：1.一种m6A测序的peak功能元件注释方法，其特征在于，包括以下步骤：S1，获得目标物种的m6A测序结果，并利用call-peak软件得到peak信息；S2，获得目标物种的基因组，并获得蛋白编码类型的转录本注释信息，包括基因信息、各功能元件的区间位置信息和相对于基因组的正负链信息；S3，将步骤S1获得的peak信息，与步骤S2获得的转录本注释信息进行比对，获得每一个peak的功能元件注释结果，具体注释方法为，若某个peak与某个功能元件之间满足：1所述peak所在的染色体与所述功能元件所在的染色体相同；2所述peak所对应的基因与所述功能元件所在的基因相同；3所述peak相对于基因组的正负链信息与所述功能元件相对于基因组的正负链信息相同，4所述peak所在的染色体上的起始位置和终止位置与所述功能元件区间有交集，则将所述功能元件的类型作为所述peak的注释。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 杭州联川生物技术股份有限公司 一种m6A测序的peak功能元件注释的方法、系统、设备和介质
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