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申请/专利权人：南京农业大学三亚研究院;南京农业大学;广西壮族自治区农业科学院

摘要：本发明提供了一种大豆耐荫基因GmYUC2的KASP标记及其应用，所述KASP标记为与大豆耐荫基因GmYUC2密切相关的3个SNP突变位点的KASP标记，其中soySNP‑1在40886611bp发生了碱基C至T的替换、soySNP‑2在40886699bp发生了碱基C至T的替换、soySNP‑3在40888609bp发生了碱基G至A的替换。本发明提供的基于KASP方法的与大豆耐荫显著关联的单倍型标记，可用于大豆耐荫性状的分子标记辅助选择育种，对于加快大豆耐荫育种的遗传改良进程，提高育种选择效率具有重要的理论和实践指导意义。

主权项：1.一种用于检测大豆耐荫性能相关的KASP标记的引物对，其特征在于，所述KASP标记为与大豆耐荫基因GmYUC2密切相关的3个SNP突变位点的KASP标记，所述3个SNP突变位点位于大豆基因组Wm82.a2.v2.0的5号染色体Chr05_40886611_40888609bp位置，其中soySNP-1在40,886,611bp发生了碱基C至T的替换，soySNP-2在40,886,699bp发生了碱基C至T的替换，soySNP-3在40,888,609bp发生了碱基G至A的替换；所述引物对序列如下：soySNP-1KASP标记上游引物F1为：5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCTAGAAAAGAACATACTATCAATATCAAAGGC-3’；soySNP-1KASP标记上游引物F2为：5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATTAGAAAAGAACATACTATCAATATCAAAGGT-3’；soySNP-1KASP标记下游引物R为：5’-CATGGTCCTCAATAGTTAGCATGC-3’；soySNP-2KASP标记上游引物F1为：5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCTACTATTAACTCTAAAGAAACAAAACTCTTTG-3’；soySNP-2KASP标记上游引物F2为：5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATTACTATTAACTCTAAAGAAACAAAACTCTTTA-3’；soySNP-2KASP标记下游引物R为：5’-GCATGCTAACTATTGAGGACCATG-3’；soySNP-3KASP标记上游引物F1为：5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCTACAGAAACTAATAGACAGCTAGTTAAAG-3’；soySNP-3KASP标记上游引物F2为：5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATTACAGAAACTAATAGACAGCTAGTTAAAA-3’；soySNP-3KASP标记下游引物R为：5’-CATCAGCAGCCACCAATTCAAATA-3’。

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