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申请/专利权人:广州益善医学检验所有限公司
摘要:本发明提供了一种肺癌MRD检测用捕获探针池和检测试剂盒。所述捕获探针池中包含针对16个肺癌相关基因设计的呈交错分布的正链和负链捕获探针,能够覆盖全部目标基因序列,不仅可有效避免因探针间的相互杂交导致的探针利用率低、捕获效率低、背景噪音高等问题,而且可同时捕获文库中目标基因的正、负链两条链,提高了文库丰度,提高了杂交捕获效率。本发明还提供了包括上述肺癌MRD检测用捕获探针池和杂交液的肺癌MRD检测试剂盒,其具有良好的检测灵敏度和特异性,且背景低、杂交捕获时间短,可有效检出16个肺癌相关基因的各种变异类型,能够很好地实现肺癌MRD检测。
主权项:1.一种肺癌MRD检测用捕获探针池,其特征在于,所述捕获探针池由针对至少一种目标基因的正链捕获探针和负链捕获探针组成,每种目标基因的捕获探针根据目标基因的正链和负链核苷酸序列依次设计、呈交错排列,能够覆盖目标基因的全部序列;所述正链捕获探针和负链捕获探针中,相邻的两个捕获探针,一个为正链捕获探针,另一个则为负链捕获探针,且所针对的目标基因序列没有重叠,所述捕获探针池中的每条捕获探针长度为80~130bp;所述目标基因选自以下16种中的至少一种:ALK、BRAF、EGFR、HER2、KRAS、MET、NRAS、MEK1、PIK3CA、RET、ROS1、TP53、NTRK1、NTRK2、NTRK3和PD-L1。
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