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一种DNA纳米笼探针及其制备方法与应用 

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申请/专利权人:湖南大学

摘要:本发明公开了一种DNA纳米笼探针及其制备方法与应用。该纳米笼探针包括具有内部空腔的DNA框架、由双链RFRQ构成的miRNA响应探针与A‑HP发夹。该纳米笼探针的制备方法包括:将双链RFRQ与DNA框架进行退火组装,然后再与A‑HP发夹孵育,形成所述DNA纳米笼探针。本发明得益于DNA纳米框架的尺寸选择性,更小的成熟miRNA而不是更大的pre‑miRNA才能进入DNA纳米笼的空腔进行分子识别,从而显著减少了pre‑miRNA的信号干扰。同时,DNA纳米笼探针无需转染即可进入细胞中并在内源性酶APE1的驱动下对细胞内miRNA成像进行精准检测。

主权项:1.一种DNA纳米笼探针,其特征在于,所述DNA纳米笼探针包括三个模块:具有内部空腔的DNA框架、miRNA响应探针与A-HP发夹;所述DNA框架为由若干条DNA链作为主体骨架自组装形成的几何体,该DNA框架具有尺寸选择能力;所述miRNA响应探针为由双链RFRQ构成的DNA结构;所述双链RFRQ由单链RF与单链RQ杂交而成,其中单链RF具有与靶标miRNA核苷酸序列互补的核苷酸序列,单链RF的5’端与3’端均具有与DNA框架的部分核苷酸序列互补的核苷酸序列;双链RFRQ能与靶标miRNA发生toehold链交换反应进行信号识别;双链RFRQ上标记有荧光基团与相应的猝灭基团;所述miRNA响应探针通过单链RF的5’端与3’端含有的与DNA框架互补的部分核苷酸序列杂交而组装在DNA框架内;所述A-HP发夹从5’端到3’端依次包括stem-1区侧链、环区、stem-2区侧链和linker区,所述stem-1区侧链、环区、stem-2区侧链和linker区均为单链核苷酸;其中,stem-2区侧链上含有能被APE1酶特异性识别切割的AP位点,stem-1区侧链和stem-2区侧链的核苷酸序列互补杂交形成双链核苷酸;linker区具有与DNA框架的部分核苷酸序列互补的核苷酸序列;A-HP发夹通过所述linker区组装在DNA框架上。

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