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一种可操作切断的DNA编码苗头化合物的鉴定方法 

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申请/专利权人:成都先导药物开发股份有限公司

摘要:本发明涉及一种可操作切断的DNA编码苗头化合物的鉴定方法,包括根据DNA编码化合物库筛选分析得到DNA苗头化合物,按照DNA编码化合物库合成策略在带有可操作切断基团的DNA上进行潜在的苗头化合物的重合成,在特定条件下进行苗头化合物释放,然后与靶点进行亲和孵育,利用质谱对洗脱物进行分子鉴定,从而精确鉴定苗头化合物。本发明可以实现DNA编码苗头化合物的精确、快速发现,并且通过可操作切断基团以避免DNA的影响。

主权项:1.一种可操作切断的DNA编码苗头化合物的鉴定方法,其特征在于:该方法包括以下步骤:1带有可切断基团的DNA编码苗头化合物的合成:针对靶点蛋白DNA编码化合物库筛选数据信号,按照其富集度由高到低进行排序,确定潜在的DNA编码苗头化合物的分子序列信息及合成路径,并以所述合成路径在带有可操作切断基团的DNA上对所有潜在的DNA编码苗头化合物进行合成;2苗头化合物的释放:将上述带有可切断基团的DNA编码苗头化合物进行切断操作,然后通过过滤器滤掉DNA部分,得到不含DNA的苗头化合物;3样本组的准备:使用筛选缓冲液配制所述不含DNA的苗头化合物的筛选前样本;实验组将筛选前样本与靶点蛋白、固定蛋白所用磁珠进行共同孵育;参照组将筛选前样本与固定蛋白所用磁珠进行孵育;再使用洗脱缓冲液对实验组与参照组分别进行洗脱,分别收集洗脱液作为实验组洗脱样本和参照组洗脱样本;4通过质谱进行结构鉴定:采用高效液相色谱质谱联用系统对测试样本进行分子量的测定,测试样本包括筛选前样本、实验组洗脱样本和参照组洗脱样本;筛选前样本中发现的所有产物分子量,都在实验组洗脱样本和参照组洗脱样本的质谱中进行分别提取并对比,若某分子的分子量在实验组洗脱样本中的提取离子强度的信噪比除以该分子量在参照组洗脱样本中的提取离子强度的信噪比所得的比值大于1,则判断该分子为与靶点蛋白结合的苗头化合物;其中,信噪比为提取离子强度除以背景离子强度;所述带有可操作切断基团的DNA上的DNA编码苗头化合物的结构为:

全文数据:

权利要求:

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