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申请/专利权人：渊慧科技有限公司

摘要：用于执行蛋白结构预测和蛋白结构域分割的方法、系统和装置，其包括在计算机存储介质上编码的计算机程序。在一个方面，一种方法包括生成蛋白的多个预测结构，其中生成蛋白的预测结构包括：更新蛋白的多个结构参数的初始值，包括在多个更新迭代中的每一个处：确定结构参数的当前值的质量得分相对于结构参数的当前值的梯度；以及使用所述梯度更新结构参数的当前值。

主权项：1.一种由一个或多个数据处理装置执行的用于确定给定蛋白的最终预测结构的方法，其中所述给定蛋白包括氨基酸序列，其中所述给定蛋白的预测结构由多个结构参数的值来定义，所述方法包括：生成所述给定蛋白的多个预测结构，其中生成所述给定蛋白的预测结构包括：获得定义所述预测结构的多个结构参数的初始值；更新所述多个结构参数的初始值，包括，在多个更新迭代中的每一个处：确定表征由所述结构参数的当前值定义的所述预测结构的质量的质量得分，其中所述质量得分基于一个或多个评分神经网络的相应输出，每个评分神经网络被配置为处理：i所述结构参数的当前值，ii所述给定蛋白的氨基酸序列的表示，或iii两者；和对于所述多个结构参数中的一个或多个：确定所述质量得分相对于所述结构参数的当前值的梯度；以及使用所述质量得分相对于所述结构参数的当前值的梯度来更新所述结构参数的当前值；以及在所述多个更新迭代中的最终更新迭代之后，将所述给定蛋白的预测结构确定为由所述多个结构参数的当前值定义；以及选择所述给定蛋白的所述多个预测结构中的一个预测结构作为所述给定蛋白的最终预测结构，其中：所述一个或多个评分神经网络包括距离预测神经网络，所述距离预测神经网络被配置为处理包括所述给定蛋白的氨基酸序列的表示的输入以生成所述给定蛋白的距离图；所述距离图对于所述给定蛋白的氨基酸序列中的多对氨基酸中的每一对，定义在该对氨基酸之间的可能距离范围内的相应概率分布；和确定表征由所述结构参数的当前值定义的所述预测结构的质量的质量得分包括，对于所述给定蛋白的氨基酸序列中的每一对氨基酸：使用在由所述距离图定义的该对氨基酸之间的可能距离范围内的相应概率分布，确定该对氨基酸被由所述结构参数的当前值定义的距离隔开的概率，以及基于在所述给定蛋白的氨基酸序列中的每一对氨基酸上，根据在由所述距离图定义的该对氨基酸残基之间的可能距离范围内的相应概率分布的、该对氨基酸被由所述结构参数的当前值定义的距离隔开的概率的乘积，确定所述质量得分。

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