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基于文本的MicroRNA和基因关系挖掘方法、装置、设备及介质 

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申请/专利权人:陈柏鸣

摘要:本发明涉及一种基于文本的MicroRNA和基因关系挖掘方法、装置、设备及介质,属于MicroRNA靶基因配对技术领域,解决了现有技术中发现新配对的过程存在效率低,耗时长,人力成本消耗巨大的问题。本发明技术方案主要包括:S1、获取生物学文本,将所述生物学文本输入大语言模型,以提取MicroRNA信息和基因信息,所述MicroRNA信息和基因信息均包括名称、调控功能列表和对应疾病列表;S2、构建MicroRNA和基因关系对,将关系对中的所述MicroRNA信息和所述基因信息输入预测模型以获得关系预测结果;所述预测模型包括疾病相似度模块、理化结合性评估模块、调控功能语义相似度模块以及分类器模块。

主权项:1.一种基于文本的MicroRNA和基因关系挖掘方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、获取生物学文本,将所述生物学文本输入大语言模型,以提取MicroRNA信息和基因信息,所述MicroRNA信息和基因信息均包括名称、调控功能列表和对应疾病列表;S2、构建MicroRNA和基因关系对,将关系对中的所述MicroRNA信息和所述基因信息输入预测模型以获得关系预测结果;所述预测模型包括疾病相似度模块、理化结合性评估模块、调控功能语义相似度模块以及分类器模块;所述疾病相似度模块用于根据MicroRNA和基因各自的对应疾病列表计算对应疾病相似度;所述理化结合性评估模块用于根据MicroRNA和基因各自的名称调用数据库中对应的结构进行预测,以获得所述MicroRNA和基因的理化结合性指标;所述调控功能语义相似度模块用于根据所述MicroRNA和基因各自的调控功能列表进行语义相似度聚类分析,以获得调控功能跨列表相似度;所述分类器用于根据所述对应疾病相似度、理化结合性指标和所述调控功能跨列表相似度输出所述MicroRNA和基因关系对的关系预测结果,所述分类器为预先基于已经验证的关系对数据进行训练得到的。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 陈柏鸣 基于文本的MicroRNA和基因关系挖掘方法、装置、设备及介质

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