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一种鉴定黄芪属和岩黄芪属的方法及其试剂盒与应用 

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申请/专利权人:东北农业大学;内蒙古草业技术创新中心有限公司

摘要:本发明提供一种鉴定黄芪属和岩黄芪属的方法及其试剂盒与应用,属于生物领域,解决了对黄芪属和岩黄芪属的精准鉴定与区分困难的问题,本发明利用DNA条形码:ITS2、psbA‑trnH、rbcL和matk设计四种引物对如SEQIDNO:1‑8所示,对基因组DNA进行PCR扩增和测序,根据特定位点碱基序列进行物种鉴定与区分,所述的黄芪属为草木樨状黄芪、达乌里黄芪、蒙古黄芪、斜茎黄芪,所述的岩黄芪属为山岩黄芪、华北岩黄芪。本发明实现了对黄芪属和岩黄芪属的精准鉴定与区分,具有鉴定方法简单、快速、效率高、重复性好的优点。

主权项:1.一种鉴定黄芪属和岩黄芪属内不同植物物种的方法,所述的黄芪属为草木樨状黄芪、达乌里黄芪、蒙古黄芪、斜茎黄芪,所述的岩黄芪属为山岩黄芪、华北岩黄芪,其特征在于,步骤如下:S1、从待测样品中提取基因组DNA;S2、以待测样品的基因组DNA为模板,利用DNA条形码引物组:如SEQIDNO:1和SEQIDNO:2所示引物进行PCR扩增ITS2序列片段,利用DNA条形码引物组:如SEQIDNO:3和SEQIDNO:4所示引物进行PCR扩增psbA-trnH序列片段;利用DNA条形码引物组:如SEQIDNO:5和SEQIDNO:6所示引物进行PCR扩增rbcL序列片段;利用DNA条形码引物组:如SEQIDNO:7和SEQIDNO:8所示引物进行PCR扩增matk序列片段;S3、得到扩增产物,经过测序、校对、特征比对,对扩增后的目标DNA条形码序列构建进化树;S4、确定待检测样品的物种:若ITS2基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:9所示,在第27位碱基型为T,则判定该物种为草木樨状黄芪,若ITS2基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:10所示,在第2位碱基型为C和第379位碱基型为A,则判定该物种为达乌里黄芪,若ITS2基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:11所示,在第2位碱基型为C和第379位碱基型为C,则判定该物种为斜茎黄芪,若ITS2基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:12所示,在第81位碱基型为A和第238位碱基型为T,则判定该物种为蒙古黄芪;若psbA-trnH基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:13所示,在第5位碱基型为A,则判定该物种为草木樨状黄芪;若psbA-trnH基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:14所示,在第160位碱基型为C,则判定该物种为山岩黄芪;若psbA-trnH基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:15所示,在第169位碱基型为C,则判定该物种为华北岩黄芪;若psbA-trnH基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:16所示,在第176位碱基型为G,则判定该物种为达乌里黄芪;若psbA-trnH基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:17所示,在第83位碱基型为G,则判定该物种为斜茎黄芪;若rbcL基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:18所示,在第37位碱基型为G,则判定该物种为草木樨状黄芪;若rbcL基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:19所示,在第37位碱基型为A,则判定该物种为蒙古黄芪;若rbcL基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:20所示,在第37位碱基型为C,则判定该物种为斜茎黄芪;若rbcL基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:21所示,在第38位碱基型为G,则判定该物种为达乌里黄芪;若matk基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:22所示,在第16位碱基型为G,则判定该物种为达乌里黄芪;若matk基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:23所示,在第204位碱基型为C,则判定该物种为斜茎黄芪;若matk基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:24所示,在第189位碱基型为A,则判定该物种为草木樨状黄芪;若matk基因片段的DNA条形码,其核苷酸序列为SEQIDNO:25所示,在第94位碱基型为C和第670位碱基型为T,则判定该物种为蒙古黄芪。

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权利要求:

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