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活细胞核糖体RNA可视化系统及其用途 

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申请/专利权人:浙江大学

摘要:本发明公开了一种活细胞核糖体RNA可视化系统及其用途。具体地说,本发明建立了一个靶向rRNA生成的高效筛选系统,该筛选系统基于本发明新开发的活细胞rRNA荧光报告分子。该系统和传统的筛选策略相比,能够极大简化筛选流程,节省筛选时间,因此显著地提高了筛选效率。

主权项:1.一种基因工程细胞在筛选药物中的应用,其特征在于,所述基因工程细胞的rDNA中整合有外源DNA序列,所述外源DNA序列编码RNA标记序列,在rDNA转录时所述RNA标记序列成为rRNA的一部分;所述外源DNA序列在所述rDNA的插入位点为5.8S区域;所述基因工程细胞还表达与所述RNA标记序列特异性结合的融合蛋白,所述融合蛋白的编码基因如SEQIDNo.12或SEQIDNo.13所示;基于CRISPR-Cas9的基因编辑系统,采用同源臂介导的DNA修复或者非同源臂介导的DNA修复方式把所述外源DNA序列插入到rDNA的5.8S区域,进而标记rRNA;所述外源DNA序列如SEQIDNo.1所示;其中,采用同源臂介导的DNA修复方式,把如SEQIDNo.2所示的修复模板序列插入到rDNA的5.8S区域;或者,采用非同源臂介导的DNA修复方式,把如SEQIDNo.3所示的修复模板序列插入到rDNA的5.8S区域;用于靶向插入5.8S区域的CRISPRsgRNA序列如SEQIDNo.8所示;用于靶向修复模板质粒线性化的CRISPRsgRNA序列如SEQIDNo.11所示;所述筛选药物的步骤包括:i将待筛选化合物与所述的基因工程细胞接触,以及ii观察所述基因工程细胞细胞核内的指示rRNA表达量的荧光强度;如果荧光强度降低说明该化合物具有潜在抑制细胞增殖活性,如果荧光强度升高说明该化合物具有潜在抑制rRNA剪切或促进rRNA转录的活性。

全文数据:

权利要求:

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