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肉用褐牛基因组低密度芯片的制备方法 

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申请/专利权人:新疆畜牧科学院畜牧研究所

摘要:本发明涉及褐牛基因组芯片领域,公开了肉用褐牛基因组低密度芯片的制备方法,包括以下步骤:S10、基因组数据收集:通过高通量测序技术来获取DNA序列,以此对肉用褐牛的基因组数据进行收集,在完成收集后进行对比,选择其中与重要性状相关的基因区域;S20、数据精化处理:对数据进行预处理,并采用全基因组关联分析算法对已对比划分的基因区域进行精化处理;S30、SNP标记选择:基于聚类算法模型,自动筛选和优化SNP,以选择最具品种代表性和预测能力的标记。通过高通量测序技术获取肉用褐牛的基因组数据,并利用生物信息学方法对其进行分析和对比,快速准确地识别与重要性状相关的基因区域,助于选择具有良好遗传特性的个体进行选择和交配,提高遗传改良的效率。

主权项:1.肉用褐牛基因组低密度芯片的制备方法,其特征在于筛选符合肉用褐牛品种特性的同时与肉用褐牛重要经济性状强关联SNP位点集合,包括以下步骤:S10、基因组数据收集:通过高通量测序技术来获取DNA序列,以此对肉用褐牛的基因组数据进行特征位点收集,在完成收集后进行对比,选择其中与重要性状相关的基因区域;S20、数据精化处理:对数据进行预处理,并采用关联分析算法对已对比划分的基因区域进行精化处理;S30、SNP标记选择:基于聚类算法模型,自动筛选和优化单核苷酸多态性标记SNP,以选择最具代表性和预测能力的标记;S40、探针设计:根据选定的SNP标记,设计用于芯片的探针;S50、芯片制备:利用自动化设备进行芯片制备,包括探针的固定和芯片的加工,并在制备过程中安装时间序列预测模型进行监督;S60、芯片验证:使用已知遗传信息的样本来检测芯片的性能。

全文数据:

权利要求:

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