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申请/专利权人：山东大学

摘要：本发明公开了一组伯克氏菌基因组合理简约化突变株与一组基因组合理简约化伯克氏菌底盘菌株及其构建方法和其在β‑变形菌纲来源的天然产物的高效异源表达中的应用。其中所述基因组合理简约化的突变株是DT8，DT9和DT10，是连续删除转座酶、前噬菌体、基因组岛等细胞生长非必需基因，并在此基础上继续删除在该菌中本底表达的生物合成基因簇后获得。同时本发明通过在DT8，DT9和DT10基因组上定点插入phiC31attB位点构建了一组基因组合理简约化的伯克氏菌底盘菌株DT8‑attB，DT9‑attB和DT10‑attB，并实现了将所述底盘菌株应用于β‑变形菌纲中天然产物如埃博霉素的产量优化及隐秘生物合成基因簇的高效异源表达。有力扩展了革兰阴性菌异源宿主底盘菌，促进了细菌中新型天然产物的挖掘。

主权项：1.一组基因组合理简约化的伯克氏菌SchlegelellabrevitaleaDSM7029突变株，其特征在于：所述突变株是以野生型伯克氏菌DSM7029为出发菌，删除其基因组Tn1区域、Tn2区域、Tn34区域、Tn5-GI3区域、Tn6-GI1区域、Prophage1区域、Prophage2-GI7区域和生物合成基因簇5制得的基因组简约化的伯克氏菌DSM7029ΔTn1ΔTn2ΔTn34ΔTn5-GI3ΔTn6-GI1ΔProphage1ΔProphage2-GI7ΔBGC5突变株，命名为DT8，该突变株删除了4.7％的基因组非必需区域；其中所述Tn1区域为46,274bp，是GenBank：CP011371.1，399,555-445,828bp；所述Tn2区域为30,979bp，是GenBank：CP011371.1，1,869,872-1,900,850bp；所述Tn34区域为64,539bp，是GenBank：CP011371.1，4,789,725-4,854,263bp；所述Tn5-GI3区域为27,328bp，是GenBank：CP011371.1，5,111,402-5,138,729bp；所述Tn6-GI1区域为36,134bp，是GenBank：CP011371.1，6,161,822-6,197,955bp；所述Prophage1区域为24,197bp，是GenBank：CP011371.1，2,396,164-2,420,360bp；所述Prophage2-GI7区域为59,887bp，是GenBank：CP011371.1，4,682,041-4,741,927bp；所述生物合成基因簇5为BGC5，17.308bp，是GenBank：CP011371.1，2,677,295-2,694,602bp；或是以DT8基因组简约化突变株为出发菌，继续删除其生物合成基因簇6制得的基因组简约化的伯克氏菌DSM7029ΔTn1ΔTn2ΔTn34ΔTn5-GI3ΔTn6-GI1ΔProphage1ΔProphage2-GI7ΔBGC5ΔBGC6突变株，命名为DT9，该突变株删除了4.8％的基因组非必需区域；其中所述生物合成基因簇6为BGC6，3,373bp，是GenBank：CP011371.1，3,093,895-3,097,267bp；或是以DT9基因组简约化突变株为出发菌，继续删除其生物合成基因簇7制得的基因组简约化的伯克氏菌DSM7029ΔTn1ΔTn2ΔTn34ΔTn5-GI3ΔTn6-GI1ΔProphage1ΔProphage2-GI7ΔBGC5ΔBGC6ΔBGC7突变株，命名为DT10，该突变株删除了4.9％的基因组非必需区域；其中所述生物合成基因簇7为BGC7，7,588bp，是GenBank：CP011371.1，3,195,049-3,202,636bp。

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百度查询： 山东大学 一组基因组合理简约化的伯克氏菌突变株与底盘菌株及其构建方法和应用