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一种基于RPA-CRISPR的唐菖蒲伯克霍尔德氏菌(椰毒假单胞菌酵米面亚种)特异性靶标、引物和检测体系及方法 

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申请/专利权人:华南农业大学

摘要:本发明公开了一种基于RPA‑CRISPR的唐菖蒲伯克霍尔德氏菌椰毒假单胞菌酵米面亚种特异性毒力基因靶标、引物和检测体系及方法。本发明所述靶标序列、RPA引物和crRNA具有良好的特异性,所构建的检测方法对其它亚种无特异性识别反应,检测结果准确可靠。此外,本发明所述检测方法结合煮沸法或试剂盒提取样品DNA,在不进行菌体富集的前提下,对唐菖蒲伯克霍尔德氏菌椰毒假单胞菌酵米面亚种基因组DNA的检测灵敏度为10‑4ngμL,菌液灵敏度为1.52CFUmL。对于椰汁、大米粉和糯米粉进行添标检测,样本检出限均达到100CFUmL,样本前处理简单,操作便捷,灵敏度高,可靠性高,适用于相关监管部门对唐菖蒲伯克霍尔德氏菌椰毒假单胞菌酵米面亚种的现场快速检测。

主权项:1.一种用于检测唐菖蒲伯克霍尔德氏菌椰毒假单胞菌酵米面亚种的RPA-CRISPRCas12a组合物,其特征在于,包括基于毒力基因的唐菖蒲伯克霍尔德氏菌椰毒假单胞菌酵米面亚种特异性碱基序列、RPA引物D11-FD11-R、crRNA、CRISPRCas12a蛋白和ssDNA-FQ探针;所述碱基序列如SEQIDNO.1所示,所述RPA引物D11-FD11-R的序列如SEQIDNO.2~3所示,所述crRNA的序列如SEQIDNO.4所示,所述FQ-ssDNA的序列如SEQIDNO.5所示。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 华南农业大学 一种基于RPA-CRISPR的唐菖蒲伯克霍尔德氏菌(椰毒假单胞菌酵米面亚种)特异性靶标、引物和检测体系及方法

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