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申请/专利权人：上海浙江大学高等研究院
摘要：本发明公开了一种基于结构信息的新生抗原成熟化方法，该方法创新性地将多肽与人类白细胞抗原humanleukocyteantigen，HLA结合的复合物peptide‑HLA，pHLA构象为重点参考信息，同时兼用其他已有序列数据库信息的指导方法，用以辅助设计，可以将单个肽序列外推到扩展的变体库。本发明实施例中通过自由能微扰方法对本发明方法获得的成熟化抗原进行严格的亲和力评估，在38个设计的候选肽中有6个表现出更强的亲和力。进一步地，其中的5个候选肽得到了实验验证。这些结果表明，本发明不仅在识别和HLA分子结合具有更强亲和力的多肽表现出色，并具有更高的免疫原性潜力，展示了其在推进个性化免疫疗法中的实用性。
主权项：1.一种基于结构信息的新生抗原成熟化方法，其特征在于，包括以下步骤：1选择一条新生抗原作为参考序列，对参考序列进行突变；2基于所述参考序列以及突变后得到的肽序列，预测各序列对应的pHLA复合物结构；3利用损失函数对所述pHLA复合物进行评估；4根据评估结果，选择满足Metropolis准则的抗原形成扩展肽库；若无满足Metropolis准则的抗原，则不更新扩展肽库；5将扩展肽库中评估分数值最低的突变序列作为新的参考序列，若扩展肽库不更新则参考序列不变，对参考序列进行突变，重复步骤2-4，直至损失函数没有显著变化或达到迭代标准；6从最终得到的扩展肽库中筛选出最优的抗原作为成熟化抗原。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 上海浙江大学高等研究院 一种基于结构信息的新生抗原成熟化方法
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