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申请/专利权人：广东海洋大学
摘要：本发明涉及秋茄领域，且公开了一种秋茄种质资源分析与良种选育的方法，包括综合调查华南现有秋茄资源，收集华南地区秋茄种质资源；对收集的秋茄种质资源进行全基因组重测序，获得秋茄的全基因组序列数据；对获得的原始测序数据进行质量控制，过滤低质量reads，将高质量的reads比对到秋茄的参考基因组上；使用PCA、结构分析方法分析秋茄种质资源的群体结构，计算群体内外的遗传多样性参数；对变异位点进行功能注释，识别潜在的功能基因和功能变异；选育遗传基础较宽的优良秋茄种质；本发明能培育优质品种服务国内红树林修复，提高红树林修复质量，发挥红树林湿地的生态功能。
主权项：1.一种秋茄种质资源分析与良种选育的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1：综合调查华南现有秋茄资源，收集华南地区秋茄种质资源，分析生长情况、抗性，收集优良种源，种质于本地；S2：对收集的秋茄种质资源进行全基因组重测序，获得秋茄的全基因组序列数据，分析秋茄种质资源遗传多样性、遗传结构；S3：对获得的原始测序数据进行质量控制，过滤低质量reads，将高质量的reads比对到秋茄的参考基因组上，通过生物信息学分析检测单核苷酸多态性、插入缺失变异基因组变异；S4：使用PCA、结构分析方法分析秋茄种质资源的群体结构，计算群体内外的遗传多样性参数；S5：对变异位点进行功能注释，识别潜在的功能基因和功能变异，根据注释结果和功能验证，筛选与生长、抗性、适应性等相关的优良基因型；S6：选育秋茄优良品种，基于秋茄种质资源进行全基因组重测序分析结果与生长情况、抗性表现，选育遗传基础不同的优良秋茄种质。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 广东海洋大学 一种秋茄种质资源分析与良种选育的方法
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