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一种识别微生物共现网络中关键集群的方法 

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申请/专利权人:四川大学

摘要:本发明公开了一种识别微生物共现网络中关键集群的方法,涉及微生物技术领域,采集、处理微生物菌群种数据,识别差异菌种,构建微生物共现网络;识别微生物共现网络中所有连通网络的个数,划分为识别模块和同构模块;采用社区发现算法对识别模块中的连通网络进行集群发现,得到结构特征相似的菌种集群,归纳同一集群的菌种特征,发现关键集群;针对同构模块中的连通网络,采用图匹配技术从识别模块的连通网络中匹配得到结构相似的子图,进一步发现关键集群。本发明最大限度地识别结构或功能相似的微生物集群,对小型微生物网络进行相似网络的匹配,结合菌群生物学特征分析这些集群潜在的关联机制和共同特征,以辅助基于微生物网络中相似集群的靶向干预。

主权项:1.一种识别微生物共现网络中关键集群的方法,其特征在于,包括:步骤S100、采集、处理微生物菌群种数据,识别差异菌种;步骤S200、对于识别的差异菌种,构建微生物共现网络;步骤S300、识别微生物共现网络中所有连通网络的个数N,将菌群的节点数大于或等于预设值的连通网络划分为识别模块,其余连通网络定义为同构模块;分别将识别模块、同构模块中的连通网络按照菌群的规模从大到小进行排序;步骤S400、采用社区发现算法对识别模块中的连通网络进行集群发现,得到结构特征相似的菌种集群,归纳同一集群的菌种特征,发现关键集群;步骤S500、针对同构模块中的连通网络,采用图匹配技术从识别模块的连通网络中匹配得到结构相似的关键集群。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 四川大学 一种识别微生物共现网络中关键集群的方法

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