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申请/专利权人：圣诺菲·帕斯图尔公司
摘要：本公开文本涉及一种用于产生重组血凝素HA多肽的基于簇的共有化方法。本公开文本进一步涉及包含所述重组HA多肽的流感疫苗组合物。
主权项：1.一种产生包括共有氨基酸的重组流感血凝素HA多肽的方法，其中所述方法包括：a.选择多于一个流感HA多肽序列并比对所述序列；b.计算成对相似度不相似度矩阵；c.从所述成对相似度不相似度矩阵中鉴定并创建相似序列的簇；d.在每个簇中，在所述序列比对中使用成对比对方法确定每个位置是否存在共有氨基酸，其中如果给定位置的氨基酸频率为50％或更高，则将所述氨基酸指定为共有氨基酸，而如果给定位置的氨基酸频率小于50％，则将所述氨基酸指定为可变氨基酸；e.为每个簇产生包括共有氨基酸和可变氨基酸的第一序列；f.在步骤e中产生的所述第一序列中，通过以下确定每个可变氨基酸位置的共有氨基酸：i.基于所述第一序列产生一组测试序列，其中测试氨基酸位于所述可变氨基酸位置；ii.对每个所述测试序列进行分子建模，其中所述分子建模包括i与流感HA多肽或蛋白质的晶体结构进行比较；ii使用Rosetta或任何其他分子建模软件；或i和ii两者；iii.通过选择导致多肽具有负总能量值的一个或多个氨基酸来确定每个可变氨基酸位置的共有氨基酸；以及g.产生包括所述共有氨基酸的重组流感HA多肽。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 圣诺菲·帕斯图尔公司 产生包含血凝素的广泛保护性疫苗组合物的方法
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