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与冬瓜首雌花节位连锁的CAPS分子标记及其应用 

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申请/专利权人:广东省农业科学院蔬菜研究所

摘要:本发明公开了一种与冬瓜首雌花节位紧密连锁的CAPS分子标记,所述CAPS分子标记根据冬瓜基因组第二染色体上第35860260位的SNP位点设计,该SNP位点存在TC的碱基突变,在高首雌花节位中该SNP位点为C,在低首雌花节位中该SNP位点为T,还公开了检测所述CAPS分子标记的引物序列,所述上游引物BhFFFN‑F的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示,所述下游引物BhFFFN‑R的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示,还公开了包括所述引物的试剂盒,利用所述引物鉴定冬瓜首雌花节位高低的方法,以及上述引物、试剂盒或方法在苗期鉴定冬瓜首雌花节位表型中的应用以及在冬瓜分子标记辅助育种中的应用。

主权项:1.一种冬瓜首雌花节位高低的鉴定方法,其特征在于包括以下步骤:(1)提取待测冬瓜的DNA;(2)采用检测CAPS分子标记的引物进行PCR扩增;(3)PCR产物经酶切、电泳后,根据结果鉴定冬瓜首雌花节位高低,在高首雌花节位单株中产生一条1306bp条带,在低首雌花节位单株中产生806bp和500bp两条条带,在中间型单株中同时产生1306bp、806bp和500bp三条条带;步骤(2)中所述CAPS分子标记根据冬瓜基因组第二染色体上第35860260位的SNP位点设计,该SNP位点存在TC的碱基突变,在高首雌花节位中该SNP位点为C,在低首雌花节位中该SNP位点为T;其中冬瓜基因组的版本号为WaxgourdBenincasahispidacv.B227genome;步骤(2)中所述引物包括上游引物BhFFFN-F和下游引物BhFFFN-R,其中所述上游引物BhFFFN-F的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示,所述下游引物BhFFFN-R的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示;步骤(3)中酶切时,采用HindIII限制性内切酶。

全文数据:

权利要求:

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