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申请/专利权人：广州基迪奥生物科技有限公司
摘要：本申请实施例公开了一种基于单细胞全转录组测序数据的分析方法、系统、装置，其包括以下步骤，lncRNA分析：选择lncRNA注释比对参考，将比对到基因组上的reads组装成转录本，基于转录本进行分析，发现新的lncRNA分子并确定lncRNA的基本特性；单细胞全转录组定量分析：将reads与参考基因组进行比对，将reads注释为特定基因；再对UMI进行修正和统计后，获得未过滤的feature‑barcode矩阵；亚群上调表达基因分析：各个亚群筛选特异表达的基因marker，采用seurat的秩和检验对不同细胞亚群进行差异基因表达分析，筛选每个细胞亚群上调表达的基因。本申请解决现有技术中对单细胞全转录组测序数据，即scFAST‑seq数据分析不够全面具体和涉及范围不够广泛的问题。
主权项：1.一种基于单细胞全转录组测序数据的分析方法，其特征在于，其包括以下步骤：lncRNA分析：选择lncRNA注释比对参考，将比对到基因组上的reads组装成转录本，基于转录本进行分析，发现新的lncRNA分子并确定lncRNA的基本特性；单细胞全转录组定量分析：将reads与参考基因组进行比对，将reads注释为特定基因；再对UMI进行修正和统计后，获得未过滤的feature-barcode矩阵；亚群上调表达基因分析：各个亚群筛选特异表达的基因marker，采用seurat的秩和检验对不同细胞亚群进行差异基因表达分析，筛选每个细胞亚群上调表达的基因。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 广州基迪奥生物科技有限公司 一种基于单细胞全转录组测序数据的分析方法、系统、装置
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