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基于RNA感应的家蚕全基因组编辑文库筛选方法及应用 

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申请/专利权人:西部(重庆)科学城种质创制大科学中心

摘要:本发明涉及一种基于RNA感应的家蚕全基因组编辑文库筛选方法及应用,利用腺苷脱氨酶ADAR介导的RNA编辑将信号通路中markergene的检测和报告基因的翻译结合,通过报告基因的表达水平变化,实时监测markergene的表达情况,并对发生变化的家蚕细胞进行可视化和分选。本发明所述基于RNA感应的家蚕全基因组编辑文库筛选报告系统,可以直接检测、标记和筛选markergene发生变化的家蚕细胞,而不需要将任何外源DNA整合到宿主基因组中。该系统在家蚕中以简单、通用和可推广的方式发挥作用,将为家蚕的全基因组编辑及功能基因的高通量筛选奠定坚实基础,具有广泛的应用前景。

主权项:1.一种基于RNA感应的家蚕全基因组编辑文库筛选方法,其特征在于,将外源RNA感应系统导入家蚕细胞进行表达,所述外源RNA感应系统的基本结构如式1所示:式15’X-A-sesRNA-B-Y3’其中,X为内参基因Marker,A为自剪接肽1,sesRNA为含有UAG密码子的用于感应trgRNA存在的RNA序列,所述trgRNA由信号通路中的标志基因所编码,B为自剪接肽2,Y为报告基因Reporter;其中,内参基因的翻译不受RNA感应影响,自剪接肽用于释放内参基因和报告基因,正常情况下,sesRNA与trgRNA匹配并结合,招募ADAR使sesRNA中的UAG密码子变为UIG密码子,令报告基因正常翻译,而当trgRNA的表达水平受信号通路中其他基因缺失的影响时,能够正常与sesRNA匹配的量也随之改变,使报告基因的翻译水平发生相应的变化,因此,可通过检测报告基因的翻译情况对家蚕全基因组编辑文库进行筛选。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 西部(重庆)科学城种质创制大科学中心 基于RNA感应的家蚕全基因组编辑文库筛选方法及应用

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