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申请/专利权人:山东大学
摘要:本发明公开了一种基于高光谱图像的肿瘤多基因检测方法,属于突变样本检测技术领域,具体包括:获取经过HE染色的不同致癌驱动基因突变状态的肿瘤组织切片;通过高光谱相机拍摄肿瘤组织切片,获取肿瘤样本的高光谱图像并预处理;基于S3Anet搭建全局特征提取器;搭建肿瘤多基因检测模型并利用多任务学习训练;收集待检测的肿瘤样本,通过高光谱相机获取该待检测样本的高光谱数据;将高光谱数据输入到经过训练的S3ANet模型中进行特征提取,再输入到训练好的多基因检测模型,得出肿瘤样本的基因检测结果。本发明的有益效果是:本发明有效减少了对传统病理学诊断经验和基因测序的依赖,显著提高了检测的准确性、可靠性及泛化能力,同时降低了检测成本。
主权项:1.基于高光谱图像的肿瘤多基因检测方法,其特征在于,所述检测方法包括以下步骤:步骤S1:收集肿瘤组织样本,获取经过HE染色的不同致癌驱动基因突变状态的肿瘤组织切片,并进行低温保存;步骤S2:获取环境光光谱特性,通过无荧光、白色漫反射材料作为参照物,采集参照物区域的高光谱数据,经过平均处理得到环境光特征曲线;步骤S3:解冻肿瘤组织样本,通过高光谱相机拍摄肿瘤组织切片,获取肿瘤样本的高光谱图像,所述肿瘤样本的高光谱图像包括光谱维和立体空间维;步骤S4:对肿瘤样本的高光谱图像进行预处理;步骤S5:基于S3Anet搭建全局特征提取器,其中S3ANet为3D卷积神经网络与自注意力机制结合的基本结构框架,用于提取肿瘤样本的形态及光学特征,并通过自监督学习任务训练模型以自动提取高光谱数据的特征;步骤S6:搭建肿瘤多基因检测模型并利用多任务学习训练,肿瘤多基因检测模型利用由S3ANet提取的特征向量,通过多个任务特定层对每个基因的突变状态进行二分类,优化多个基因的检测结果;步骤S7:收集待检测的肿瘤样本,通过高光谱相机获取该待检测样本的高光谱数据;步骤S8:将步骤S7中获得的高光谱数据输入到经过训练的S3ANet模型中进行特征提取,将得到的特征向量输入到训练好的多基因检测模型,利用该模型预测待检测肿瘤样本的基因突变状态,输出肿瘤样本的基因检测结果。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 山东大学 基于高光谱图像的肿瘤多基因检测方法
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