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申请/专利权人:华北理工大学;青海师范大学
摘要:本发明公开了一种检测高血压相关基因及基因功能分析的系统。包括:基因预处理单元,用于对高血压基因表达数据进行预处理获得基因表达矩阵;基因样本分析单元,基于基因表达矩阵分析样本分布情况;基因差异分析单元,基于基因表达矩阵筛选发生显著变化的差异基因,获得基因差异矩阵;基因模块分析单元,基于基因表达矩阵通过加权基因共表达网络方法确定基因模块并筛选关键模块;Hub基因分析单元,用于筛选关键基因中的Hub基因;基因功能分析单元,用于对差异表达基因或基因模块进行功能富集分析及通路与基因关系的网络分析。本发明可以辅助不熟悉高血压基因相关数据库和分析流程的科研人员准确有效的发现与高血压等复杂疾病相关的基因与通路。
主权项:1.一种检测高血压相关基因及基因功能分析的系统,其特征在于,该系统的基因预处理单元生成的基因表达矩阵,首先传输到基因样本分析单元对数据进行可视化分析,然后传输到基因差异分析单元进行基因表达差异分析,再将基因差异分析单元生成的差异表达基因传输到基因功能分析单元;或者将基因样本分析单元输出的数据传输到基因模块分析单元用于确定基因模块和筛选关键基因模块,再将关键基因模块传输到Hub基因分析单元和基因功能分析单元;基因预处理单元,用于对高血压基因表达数据进行校正与归一化预处理获得基因表达矩阵;基因样本分析单元,基于基因样本分析单元获得的基因表达矩阵对样本表达及分布情况进行可视化分析;基因差异分析单元,基于基因样本分析单元获得的基因表达矩阵筛选表达发生显著变化的差异基因,获得基因差异矩阵,并对其进行可视化;筛选差异表达基因的差异倍数,是通过logFC绝对值的均值+2倍logFC绝对值的标准差获得的,通过FDR方法校正P值得到差异性基因的表达数据,并将差异表达基因与NCBI和geneCards数据库相结合,便于直接查询差异基因的生物学意义;基因模块分析单元,基于基因样本分析单元获得的基因表达矩阵通过加权基因共表达网络方法确定基因模块,并筛选关键基因模块;Hub基因分析单元,用于筛选关键基因模块中的Hub基因,并可视化Hub基因在不同分组中的表达情况;基因功能分析单元,用于对差异表达基因或关键基因模块等基因进行功能富集分析,并进行通路与基因关系的网络分析。
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权利要求:
百度查询: 华北理工大学 青海师范大学 一种检测高血压相关基因及基因功能分析的系统
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