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申请/专利权人:科迈生物科技(苏州)有限公司
摘要:本申请涉及一种基于人源抗体骨架库生成抗体的方法、装置和设备及存储介质。该方法包括:获取目标抗原的结构和序列、目标表位区域,以及人源抗体骨架库中人源抗体的结构和序列;从人源抗体骨架库中筛选出满足第一预设条件候选抗体;将候选抗体与目标抗原进行对接,调整候选抗体的对接姿态,得到对接结构;对每个对接结构中抗体的CDR区进行优化,筛选得到多个优化后的对接结构和抗体序列;对多个优化后的对接结构和抗体序列进行多角度计算,筛选出满足预设组合筛选条件的优化后的对接结构,并将优化后的对接结构中的抗体作为目标抗体。本申请提供的方案,能够基于人源抗体骨架库,对抗体的CDR区域进行优化,生成可结合抗原特定表位的人源抗体。
主权项:1.一种基于人源抗体骨架库生成抗体的方法,其特征在于,包括:获取目标抗原的结构和序列、目标表位区域,以及人源抗体骨架库中人源抗体的结构和序列;根据所述目标抗原的序列、所述目标表位区域,以及所述人源抗体骨架库中人源抗体的序列,从所述人源抗体骨架库中筛选出满足第一预设条件的人源抗体,并作为候选抗体;基于所述目标表位区域,将所述候选抗体与所述目标抗原进行对接,调整所述候选抗体的对接姿态,筛选得到满足第二预设条件的对接结构;基于预设算法,对每个所述对接结构中抗体的CDR区进行序列优化及结合界面进行结构优化,得到多个优化后的对接结构和抗体序列;基于预设组合算法,对多个所述优化后的对接结构和抗体序列进行多角度计算,筛选出满足预设组合筛选条件的所述优化后的对接结构和抗体序列,并将所述优化后的对接结构中抗体的结构和序列作为目标抗体的结构和序列。
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百度查询: 科迈生物科技(苏州)有限公司 基于人源抗体骨架库生成抗体的方法、装置和设备及存储介质
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