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一种基于RNA感应系统的基因组位点编辑检测方法 

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申请/专利权人:西部(重庆)科学城种质创制大科学中心

摘要:本发明涉及一种基于RNA感应系统的基因组位点编辑检测方法,利用腺苷脱氨酶ADAR介导的RNA编辑将靶基因mRNA的检测和报告基因的翻译结合,通过报告基因的表达水平变化,对靶基因编辑的活细胞进行可视化和分选。本发明所述基因组编辑报告系统可以直接检测、可视化和分选基因组编辑活细胞。该系统在不同生物体中以简单、通用和可推广的方式发挥作用,能够有效的对基因组编辑情况进行实时反馈,将为基因组编辑技术的规模化应用和新型基因编辑工具的开发奠定坚实基础,具有广泛的应用前景。

主权项:1.一种基于RNA感应系统的基因组位点编辑检测方法,其特征在于,将一个或多个不同的基因编辑报告系统导入宿主进行表达,所述基因编辑报告系统的基本结构如式1所示:式15’X-A-sesRNA-B-Y3’其中,X为内参基因,A为自剪接肽1,sesRNA为含有UAG密码子的用于感应trgRNA存在的RNA序列,所述trgRNA由野生型靶基因所编码,B为自剪接肽2,Y为报告基因;其中,内参基因的翻译不受RNA感应影响,自剪接肽用于释放内参基因和报告基因,当野生型靶基因上靶位点未发生编辑时,trgRNA可以和sesRNA正常匹配,招募ADAR使sesRNA中的UAG密码子变为UIG密码子,令报告基因正常翻译,当野生型靶基因上靶位点发生编辑后,trgRNA和sesRNA匹配异常,影响ADAR的招募,进而抑制报告基因的翻译;通过检测报告基因的翻译情况对基因组位点编辑情况进行检测。

全文数据:

权利要求:

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