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申请/专利权人:嘉应学院
摘要:本发明涉及基因数据分析技术领域,具体涉及一种用于鱼类的基因数据智能分析方法及系统。本发明通过分析鱼类不同种群在不同周期下的DNA序列,以揭示生物基因表达的动态变化及种群间的遗传关系。基于不同种群在相同周期下DNA序列之间的差异及每个种群在不同周期下DNA序列的变化波动,确定种群间的基因特性相似值。进一步地,通过分析不同种群的DNA序列之间碱基的出现频次差异,确定序列同源特征值,以揭示种群间遗传序列层面的相似性。结合基因特性相似值和序列同源特征值,可以得到不同种群之间准确的遗传联系特征值,全面分析鱼类种群间的遗传关系。该发明为鱼类资源保护、管理、利用及进化历史和生态学研究提供了科学依据和参考。
主权项:1.一种用于鱼类的基因数据智能分析方法,其特征在于,所述方法包括:获取鱼类不同种群在不同周期下抽样样本的DNA序列,并将鱼类不同种群进行两两组合,得到所有不重复的种群组合;在每个种群组合中,基于两个种群在相同周期下的抽样样本的DNA序列中碱基排列顺序之间的差异情况,以及每个种群在不同周期下抽样样本的DNA序列之间的变化波动情况,确定种群组合中两个种群之间的基因特性相似值;在每个种群组合中,基于两个种群在所有周期下抽样样本的DNA序列中碱基出现频次之间的差异情况,确定种群组合中两个种群之间的序列同源特征值;基于每个种群组合中两个种群之间的基因特性相似值以及序列同源特征值确定遗传联系特征值;根据所有种群组合之间对应的所述遗传联系特征值对所有种群进行分类,分析鱼类不同种群之间的遗传关系;所述根据所有种群组合之间对应的所述遗传联系特征值对所有种群进行分类,分析鱼类不同种群之间的遗传关系,包括:在预设K值下,将种群组合对应的遗传联系特征值之间的差异值作为距离度量,基于K-means聚类算法对所有的种群组合进行聚类分析,得到聚类结果;在聚类结果的每个聚类簇中,基于可视化工具获取鱼类不同种群之间的遗传联系性。
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百度查询: 嘉应学院 一种用于鱼类的基因数据智能分析方法及系统
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