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摘要:本发明涉及生物信息技术领域,尤其涉及一种甲基化组学和宏基因组学分析方法。所述方法包括:针对待测样本的全基因组亚硫酸盐测序数据预处理后得到待分析数据;针对所述待分析数据进行甲基化分析、细菌和真菌微生态分析以及噬菌体分析。本发明联合甲基化组学和微生物宏基因组学针对全基因组亚硫酸盐测序数据进行分析,可以有效筛选到和脓毒症鉴定及相关分析有关的生物因素,这些生物因素可以用于脓毒症鉴定、脓毒症感染部位预测以及死亡率分析中,在脓毒症检测领域具有重要价值。
主权项:1.一种甲基化组学和宏基因组学分析方法,其特征在于,包括:针对待测样本的全基因组亚硫酸盐测序数据预处理后得到待分析数据;针对所述待分析数据进行甲基化分析、细菌和真菌微生态分析以及噬菌体分析;所述甲基化分析包括:采用400-600bp窗口滑动和150-250重叠分析,对于符合如下条件的位点确定为甲基化位点:i)处于启动子或外显子区域;ii)经过去重后,有3倍以上reads确定位点存在;iii)在40%的同组样本出现;iv)甲基化程度差异>20%。
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百度查询: 粤北人民医院 一种甲基化组学和宏基因组学分析方法
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