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一种基于代谢组学的溶藻弧菌野生型强毒株与Qrr1-5基因缺失型弱菌株的判别方法 

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摘要:本发明公开了一种基于代谢组学的溶藻弧菌野生型强毒株与Qrr1‑5基因缺失型弱菌株的判别方法。本发明利用溶藻弧菌中6‑磷酸葡萄糖和甘露醇的含量的比值对代谢组学研究中溶藻弧菌sRNA分子Qrr1‑5强毒株和弱毒株进行判别,待测样品中6‑磷酸葡萄糖和甘露醇的比值在1.6以上的为溶藻弧菌Qrr1‑5基因缺失型弱毒株,6‑磷酸葡萄糖和甘露醇的比值在0.6以下的为溶藻弧菌野生型强毒菌株。本发明操作简单,检测结果可靠,可为溶藻弧菌sRNA分子Qrr1‑5代谢特征分析及相关溶藻弧菌sRNA分子Qrr1‑5代谢组学研究提供借鉴。

主权项:1.一种基于代谢组学的溶藻弧菌野生型强毒株与Qrr1-5基因缺失型弱毒株的判别方法,其特征在于:通过检测溶藻弧菌中6-磷酸葡萄糖和甘露醇的含量,计算其比值,对代谢组学研究中与Qrr1-5中强毒株和弱毒株进行判别:6-磷酸葡萄糖和甘露醇的比值在1.6以上的为溶藻弧菌Qrr1-5基因缺失型弱毒株,6-磷酸葡萄糖和甘露醇的比值在0.6以下的为溶藻弧菌野生型强毒株;所述的溶藻弧菌野生型强毒株是溶藻弧菌菌株EPGS02040,菌种保藏号CCTCCNo.AB209306;所述检测溶藻弧菌中6-磷酸葡萄糖和甘露醇的含量的具体方法为:首先制备溶藻弧菌样品提取液,然后采用采用超高效液相色谱-质谱联用技术UHPLC-MS的代谢组学分析方法对溶藻弧菌样品中6-磷酸葡萄糖与甘露醇进行相对定量分析。

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百度查询: 陕西科技大学 一种基于代谢组学的溶藻弧菌野生型强毒株与Qrr1-5基因缺失型弱菌株的判别方法

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