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摘要:本发明公开了基于单细胞测序的中药海马低质量细胞筛选方法及系统,属于生物信息分析技术领域。方法包括以下步骤:S1、获取海马单细胞测序数据,生成基于唯一分子标识符数据的计数矩阵;并基于所述计数矩阵计算质量控制指标的值;S2、基于改进的MAD计算方法以及所述质量控制指标的值,识别低质量的细胞。本发明充分考虑单细胞测序数据的特点,具有良好的普适性,基于均值和标准差计算得到的MAD作为筛选阈值,可以最大程度地保留后续可以用于数据分析的海马单细胞,促进了单细胞测序技术在海洋中药海马基因鉴定与分析方面的应用。
主权项:1.基于单细胞测序的中药海马低质量细胞筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、获取海马单细胞测序数据,生成基于唯一分子标识符的计数矩阵;并基于所述计数矩阵计算质量控制指标的值;S2、基于改进的MAD计算方法以及所述质量控制指标的值,识别低质量的细胞。
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百度查询: 山东中医药大学 基于单细胞测序的中药海马低质量细胞筛选方法及系统
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