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申请/专利权人:北京中科昆朋生物技术有限公司;中国科学院昆明动物研究所
摘要:本申请提供检测马里努阿犬犬种的引物组、试剂盒、基因芯片和方法,其中所述检测马里努阿犬犬种的方法包括:采集待检测犬的基因信息;对所述基因信息进行扩增,通过预设引物组对扩增后的基因信息进行检测,获得预设数量的待检测基因位点信息集合;将所述待检测基因位点信息集合与参考基因位点信息集合进行比对;根据比对结果确定所述待检测犬对应的马里努阿犬犬种信息。通过本方法,利用少量高频基因突变位点鉴定马里努阿犬的方法,直接获得鉴定结果,不用依赖相关鉴定人员的鉴定经验,检测准确性高、可重复性高,鉴定时间短。
主权项:1.一种检测马里努阿犬犬种的引物组,其特征在于,所述引物组包括如下至少一个引物对:1第1引物对,用于检测1号染色体、第16132465位点,包括:上游引物5'-AGAAGTGGTACGACCGGGAGTACCGAAGAGAGATG-3';下游引物5'-AGGTGTACAAGGAGTACCGGTCTGACGTGTAGTTC-3';2第2引物对,用于检测1号染色体、第83654122位点,包括:上游引物5'-GGTGACTCCCGGTCGATATTACAACAGTATACAAG-3';下游引物5'-AAAAATAAAAAACGAGTAACGTGATACTATTTTCT-3';3第3引物对,用于检测1号染色体、第100851516位点,包括:上游引物5'-CGTGAATATCCCGAAGAGGGGTCACACCTATTATC-3';下游引物5'-CACAGCCTACTCCAAACACGAGGTCGTCTTCCTAA-3';4第4引物对,用于检测2号染色体、第28941540位点,包括:上游引物5'-TACTTTCCCATAACTGGGAAGGGGATTACGTGAGT-3';下游引物5'-ATGGACGATAAGATGTTCTTTTATTCAATGATACA-3';5第5引物对,用于检测2号染色体、第30205921位点,包括:上游引物5'-CTGTGTGTGTCCTGTTTTGATCACATACTCTCTCC-3';下游引物5'-GTTCCACTTTGTCAGGATTCGTCTGTCATGGACTT-3';6第6引物对,用于检测2号染色体、第31746012位点,包括:上游引物5'-ACAGGAGTGCCTCAAAAACTCTACTTTACTTCGTC-3';下游引物5'-AGCATGTTTCGTGAAACCATCGGGAAGACCGTACG-3';7第7引物对,用于检测3号染色体、第14170890位点,包括:上游引物5'-AGGAAGCCGACAAGGAGACCTCAGTCCCTCCGTGA-3';下游引物5'-AACAAATGTAGACATAGATCCGTTGGTCTTACGAC-3';8第8引物对,用于检测3号染色体、第66531301位点,包括:上游引物5'-CGTCTTCAACGGAAACGAAAAGAAAACACACGAAG-3';下游引物5'-GATTCTTAGGAAAGACTCGGATTCGTGAACAGAGG-3';9第9引物对,用于检测3号染色体、第84856562位点,包括:上游引物5'-ACATCCCAGAAACTCCCTTCCTTCACAAAGGATCA-3';下游引物5'-TAAAGAGTAGGGAGTACCCCAGGTAGTTCAATGGA-3';10第10引物对,用于检测3号染色体、第90927758位点,包括:上游引物5'-CTTTACTGGTTATAACGGTTATTCCCCCTTCAGTT-3';下游引物5'-ATCGACCACTCCCATTTTTCGTGTTTCCATGCACT-3';11第11引物对,用于检测4号染色体、第12563647位点,包括:上游引物5'-GTCCAAATCTCTATACGTTAGACTAACATGAAGTT-3';下游引物5'-TTTCTTTGATTTTCTTTGTTCACTAAATGTAATAA-3';12第12引物对,用于检测5号染色体、第79005119位点,包括:上游引物5'-AAAGTTTAGGTGCCATTCAGTCATCACGACACTTG-3';下游引物5'-AAGGTCCGTGGGTTCGAGTCCCGACTTAAACGACG-3';13第13引物对,用于检测9号染色体、第18580286位点,包括:上游引物5'-TGTCCATCGGATCATCCCACTCGAGGTATCGTTTC-3';下游引物5'-CTCAGAGGCCCAGACTCTTACTCTGGGCCATCGAC-3';14第14引物对,用于检测10号染色体、第9566309位点,包括:上游引物5'-GTAGGAGTTCCCGGGAATCGGAGTTGACCTTTTTG-3';下游引物5'-CCTTCCTAGATTGATTAGAACAAACGTCGTATGTA-3';15第15引物对,用于检测10号染色体、第17936731位点,包括:上游引物5'-AATGAAAAGGAAGCACGATGCCCATTCTGGTGGGG-3';下游引物5'-CCCCTCGTTTATCTGTTACCTGTGCAGGTCCCTGA-3';16第16引物对,用于检测10号染色体、第48367568位点,包括:上游引物5'-CGGTGACTGTTTCATGGTGTTTATCCGAAACTGAT-3';下游引物5'-TCAATTCAGTACGGGGTAAAGTAAACTCCAAGAAT-3';17第17引物对,用于检测15号染色体、第42420741位点,包括:上游引物5'-AAAAAGACTACCAAAAATTTGAATCTCGTCGACCT-3';下游引物5'-ATATCCCTCATTCATCTCCCACTCCCGATCCGACC-3';18第18引物对,用于检测15号染色体、第54199094位点,包括:上游引物5'-AAGAGTCGAGTGGCAGTAGAAAGAGAAAAACTATT-3';下游引物5'-GTGCATAAAAGTCATAAGTGATGTATCCGTTCACT-3';19第19引物对,用于检测17号染色体、第12301561位点,包括:上游引物5'-GCCAAACTCACCAAAGTTCATACAGATCTTATTCT-3';下游引物5'-AACTGTCTTAAGACGTAAAGGGTTCGTTTTCCTAA-3';20第20引物对,用于检测17号染色体、第42124552位点,包括:上游引物5'-ACACCGGTTGTGAACAAAAGGGTCACCACAAAGAA-3';下游引物5'-AGTGAAAAAGGAAGTGTACAAGAATCGTTTATTGG-3';21第21引物对,用于检测19号染色体、第24024367位点,包括:上游引物5'-TAGACCTGGACTTTAAGACCTCGACTCAGACCGGA-3';下游引物5'-CTGTTCTCCTACAGTCGAGTATACGTGATGTATGA-3';22第22引物对,用于检测19号染色体、第41657166位点,包括:上游引物5'-ACTATCACGGGTAAGAGAGATATTTAATCCTTTGT-3';下游引物5'-TCCGTACCCCGACTTTCTTTACTCTCCTTACTAAT-3';23第23引物对,用于检测23号染色体、第42168125位点,包括:上游引物5'-GTTGAGGGGGGGTGACATCCTTTTGTTGAGGTTCA-3';下游引物5'-GTCCGGTCGACTACCAATACACCATCGTAAAGAGG-3';24第24引物对,用于检测25号染色体、第16308812位点,包括:上游引物5'-ATAAGGTGAATAAAGCACACGTATTACTTACGCAG-3';下游引物5'-GTTAAAATTAAACTCGGGAGGTATATGTCAAAAGT-3';25第25引物对,用于检测27号染色体、第7639333位点,包括:上游引物5'-TTGACCGGTTGTCCCGAAAGGTCTTGGTCCATTCG-3';下游引物5'-ACAATCGAGGGTGCTTGTGGACACGAGACGACTCG-3';26第26引物对,用于检测29号染色体、第13324822位点,包括:上游引物5'-GACCTACCTTATAGAAACCCGACTCTTGAAACGGA-3';下游引物5'-ATTCCTTCAGTAAAGTTTCACATCCCAATTAAGTC-3';27第27引物对,用于检测31号染色体、第34487166位点,包括:上游引物5'-CCCTAACTACCCGAGGACTTCAGAGAAGGACCACG-3';下游引物5'-ATGGAAGTCTCTCCACGAGTGTGTGCGTACGTGTG-3';28第28引物对,用于检测32号染色体、第27385237位点,包括:上游引物5'-TCTCAACCTCAGTCTTACACGAGTTTTTCTTCATG-3';下游引物5'-TATCTGTCCCTCTTTACAAACTTCTAATGAGACAA-3';29第29引物对,用于检测36号染色体、第13959506位点,包括:上游引物5'-CGTAAGTAGTTATAGTAGTGTTGAGGCAAACAGTC-3';下游引物5'-GTATTCGAACATTGGTCCTGCTGTTCTTGTTATTT-3';30第30引物对,用于检测36号染色体、第24270932位点,包括:上游引物5'-GAACTCCATGAATCATATCAAAAAAAAGATGTACG-3';下游引物5'-CTCCTACAAGATTTCGGGAGTTATGGTGACTACTG-3'。
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