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申请/专利权人：宁夏农林科学院枸杞科学研究所
摘要：本发明涉及基因定位技术领域，尤其是一种利用|△SNP‑index|进行枸杞果实颜色基因定位方法，包括通过混池、基因组DNA提取与检测、F1群体极端植株的筛选、BSA测序建库、SNP变异检测分析、SNP关联分析及候选区域筛选的方法进行以北方枸杞为母本果色为红色，宁夏黄果为父本果色为黄色构建获得极端混池材料，利用|△SNP‑index|方法获得与枸杞果实基因相关基因序列，与现有技术相比，本发明的枸杞果实颜色基因定位方法便于能针对基因组区域对候选基因进行准确预测，定位区间小，精度较高，使用方便，便于基因定位的效率更高。
主权项：1.一种利用|△SNP-index|进行枸杞果实颜色基因定位方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：S1、混池：选择北方枸杞与宁夏黄果为亲本构建遗传群体，构建获得健康生长且结果为F1的单株，再利用色差仪对其亲本及杂交群体进行果实颜色测定；S2、基因组DNA提取与检测：提取亲本及其混池材料的DNA进行检测；S3、F1群体极端植株的筛选：根据目测法和CCI指数最终选取不同颜色的极端果实若干个单株，对这若干个不同颜色的极端果实的果实颜色指数CCI的数值进行分析后，进行BSA测序建库；S4、测序：通过高通量测序对亲本及混池的样品进行分析，通过分析结果表明的数据符合BSA检测和分析标准后用于Illumina测序分析；S5、SNP变异检测分析：对亲本及其混池材料进行SNP变异分析；S6、SNP关联分析：利用绝对值|△SNP-index|方法关联阈值判定；S7、候选区域筛选：根据|△SNP-index|的置信区间得到与果实颜色性状相关关联的染色体区域分布后进行基本筛选定位。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 宁夏农林科学院枸杞科学研究所 一种利用|△（SNP-index）|进行枸杞果实颜色基因定位方法
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