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申请/专利权人：西南大学
摘要：本申请公开了基于棒络新妇蜘蛛的数据库构方法、装置、设备及介质，涉及数据库领域，包括：组装棒络新妇蜘蛛满足第一预设高质量条件的染色体基因组；注释染色体基因组得到初始注释文件，删除初始注释文件中不满足筛选标准的基因序列的注释得到目标注释文件；基于普通转录组确定每个基因序列的表达值和共表达关系；对基于测序后单细胞转录组进行细胞簇分类得到的分类后细胞簇进行功能注释得到注释后转录组；基于测序后空间转录组确定空间结构内的细胞分布；基于目标注释文件、表达值和共表达关系、注释后转录组和空间结构内的细胞分布构建数据库。构建综合的蜘蛛数据库以方便快速获取蜘蛛的基因组以及其他组学的全面信息。
主权项：1.一种基于棒络新妇蜘蛛的数据库构建方法，其特征在于，包括：组装棒络新妇蜘蛛的满足第一预设高质量条件的染色体基因组；基于所述棒络新妇蜘蛛的若干组织分别对应的普通转录组以及与所述棒络新妇蜘蛛密切相关的各物种的蛋白质序列对所述染色体基因组进行注释得到初始注释文件，并删除所述初始注释文件中不满足筛选标准的各基因序列对应的注释得到目标注释文件；对测序后的所述普通转录组进行过滤得到满足第二预设高质量条件的高质量转录组测序序列，并基于所述高质量转录组测序序列确定每个基因序列的表达值和共表达关系；对测序后单细胞转录组进行细胞簇分类得到包含若干分类后细胞簇的分类后转录组，并对所述分类后细胞簇进行功能注释得到注释后转录组；对测序后空间转录组进行预处理，并基于预处理结果对所述测序后空间转录组进行聚类以确定空间结构内的细胞分布；根据数据库管理系统，并基于所述目标注释文件、所述表达值和所述共表达关系、所述注释后转录组和所述空间结构内的细胞分布构建基于棒络新妇蜘蛛的数据库。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 西南大学 基于棒络新妇蜘蛛的数据库构建方法、装置、设备及介质
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