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一种用于黑家鼠分子和家蝇分子溯源的方法 

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申请/专利权人:重庆国际旅行卫生保健中心(重庆海关口岸门诊部)

摘要:本发明涉及生物溯源技术领域,公开了一种用于黑家鼠分子和家蝇分子溯源的方法,包括S1、获取样本;S2、样本处理;S3核酸提取、扩增及测序;S4、序列分析。本发明可以建立系统的分子溯源技术和数据库,在疫情发生时能及时的为风险评估提供参考,有效防止传染病的传入。

主权项:1.一种用于黑家鼠分子和家蝇分子溯源的方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、获取样本;S2、样本处理:黑家鼠样本处理:剪取眼睛附近的皮毛,取部分皮毛放入1.5mlEP管内,剪取下腿部干瘪肌肉,取部分肌肉放入另一只1.5mlEP管内,向两只EP管中分别加入100ul双蒸水,放入-80℃冰箱冻存;家蝇样本处理:将样本晾干,然后取中足或后足部分研磨破碎后保存于干燥的地方;S3、核酸提取、扩增及测序:1核酸提取:采用经步骤S2处理后的黑家鼠的皮毛及部分肌肉进行核酸提取,采用经步骤S2处理后的家蝇的中足或后足进行核酸提取;基因选取:黑家鼠选择COI和Cytb基因,家蝇选择COI和ITS2基因,使用引物序列如下:黑家鼠-COI-F:5'-CCTACTCRGCCATTTTACCTATG-3';黑家鼠-COI-R:5'-ATCTCTGGGTGTCCAAAGAATCA-3';黑家鼠-Cytb-F:5'-CCAATGACATGAAAAATCATCGTT-3';黑家鼠-Cytb-R:5'-TCTCCATTTCTGGTTTACAAGAC-3';家蝇-COI-F:5'-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3';家蝇-COI-R:5'-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3';家蝇-ITS2-F:5'-TGCTTGGACTACATATGGTTGA-3';家蝇-ITS2-R:5'-GTAGTCCCATATGAGTTGAGGTT-3';黑家鼠-Cytb的基因序列见SEQIDNO.1所示;2PCR扩增:PCR反应体系为均为25ul:2×TSINGKETMMasterMix12.5ul,灭菌水9.5ul,模板2ul,上下游引物分别0.5ul;扩增程序如下:黑家鼠-COI为:94℃预变性5min,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1min,将上述程序循环35次后72℃延伸10min;黑家鼠-Cytb为:94℃预变性5min,94℃变性30s,55℃退火60s,72℃延伸60s,35个循环,再72℃延伸10min;家蝇-COI为:94℃预变性3min,94℃变性30s,53℃退火30s,72℃延伸1min,将上述程序循环35次后72℃延伸5min;家蝇-ITS2为:95℃预变性5min,94℃变性30s、53℃退火30s、72℃延伸1.5min,将上述程序循环35次后72℃延伸10min;3测序;S4、序列分析。

全文数据:

权利要求:

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