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基于16S rDNA测序获得鸡感染柔嫩艾美耳球虫后盲肠菌群变化的方法和应用 

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申请/专利权人:江苏农牧科技职业学院

摘要:本发明公开了一种基于16SrDNA测序获得鸡感染柔嫩艾美耳球虫后盲肠菌群变化的方法和应用,包括:多只待试验雏鸡分为对照组和感染组,感染组感染柔嫩艾美耳球虫;各自提取盲肠内容物DNA,并对提取后的盲肠内容物DNA采用如SEQIDNo:1和SEQIDNo:2所示的引物对扩增后,纯化回收,获得纯化扩增产物;测序,获得原始测序数据;原始测序数据经数据过滤和聚类后,获得多个可操作性分类单元;分析获得菌群多样性;根据分析结果,获得鸡感染柔嫩艾美耳球虫后盲肠菌群变化结果。本发明能够从肠道微生物多样性方向分析鸡感染柔嫩艾美耳球虫后盲肠菌群的变化,进而为柔嫩艾美耳球虫的防治效果的验证上提供新的方向。

主权项:1.一种基于16SrDNA测序获得鸡感染柔嫩艾美耳球虫后盲肠菌群变化的方法,其特征在于,所述方法包括:S100、选取多只待试验雏鸡,随机分为对照组和感染组,并将感染组的待试验雏鸡感染柔嫩艾美耳球虫;S200、对对照组和感染组的待试验雏鸡各自提取盲肠内容物DNA,并对提取后的盲肠内容物DNA采用如SEQIDNo:1和SEQIDNo:2所示的引物对扩增后,纯化回收,获得纯化扩增产物;S300、对获得的扩增产物测序,获得原始测序数据;S400、将获得的原始测序数据经数据过滤和聚类后,获得多个可操作性分类单元;S500、根据可操作分类单元,分析获得对应盲肠内容物中的菌群多样性;S600、根据步骤S500中的分析结果,获得鸡感染柔嫩艾美耳球虫后盲肠菌群变化结果。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 江苏农牧科技职业学院 基于16S rDNA测序获得鸡感染柔嫩艾美耳球虫后盲肠菌群变化的方法和应用

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