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基于深度学习的海洋贻贝微核细胞识别与计数方法及应用 

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申请/专利权人:浙江大学海南研究院

摘要:本发明属于微核细胞检测技术领域,具体涉及一种基于深度学习的海洋贻贝微核细胞识别与计数方法及应用,包括制备海洋贻贝微核装片,并采集微核照片;构建深度学习数据集;包括获取海洋贻贝细胞的图像数据,并划分训练集和测试集;为训练集和测试集的图像数据进行标注;对图像进行预处理,增强目标细胞的边缘和细节;基于深度学习的海洋贻贝微核细胞识别及计数。本发明检测通量高、效率高、不存在主观性等缺陷,应用在海洋环境检测中能够快速、准确地完成海洋环境检测任务。

主权项:1.基于深度学习的海洋贻贝微核细胞识别与计数方法,其特征在于,包括如下步骤:S1、制备海洋贻贝微核装片,并采集微核照片;S11、海洋贻贝血细胞提取:用剪刀从贻贝腹侧将壳撬开,排空内部的海水,从贻贝的后闭壳肌中抽取400μL血淋巴,在4℃,5000rpm条件下离心2min,得到去除上清液后的细胞团;S12、细胞处理:将200μL磷酸缓冲盐溶液加入离心后的细胞团,用移液器轻柔抽吸,进行细胞重悬;将细胞悬液至于温度为4℃,转速为5000转的离心机中离心2min,去除上清液;将清洗后的细胞团在100μL磷酸缓冲盐溶液中重悬;S13、附着与固定:对载玻片磨砂面进行标记,将制备好的细胞重悬液分两滴加在载玻片上,将载玻片置50℃烘箱中均匀受热烘干,使贻贝血细胞附着在载玻片上;将血细胞附着后的载玻片放入100%甲醇中固定10min,之后放置于通风橱中风干10min;S14、染色与封片:将风干后的载玻片放置于配置好的吉姆萨染料中染色5min,再用清洗液浸没载玻片2次进行清洗,每次5min;清洗好的载玻片放在通风橱内干燥后,用Eukitt胶进行封片处理;S15、微核图片采集:待装片干燥后,在显微镜下观察染色后的玻片并拍照,从而获得待测图片;S2、构建深度学习数据集;包括获取海洋贻贝细胞的图像数据,并划分训练集和测试集;为训练集和测试集的图像数据进行标注;对图像进行预处理,增强目标细胞的边缘和细节;在步骤S2中,图像预处理使用OpenCV计算机视觉库对采集到的图像集进行预处理,包括使用normalize函数和equalizeHist函数对图像进行增强,使用convertScaleAbs函数调整亮度和对比度,使用cvtColor函数进行色彩平衡,应用去噪处理,使用medianBlur函数中值滤波去除图像中的噪声干扰,根据图像的特性调整对比度;S3、基于深度学习的海洋贻贝微核细胞识别及计数;S31、利用深度学习算法YOLOv8进行目标识别,采用迁移学习,通过用COCO数据集上预训练模型的权重初始化YOLOv8s模型,通过训练识别模型YOLOv8s来准确地定位和识别海洋贻贝微核细胞;S32、模型训练:使用训练集的图像数据和相应的标签信息,训练深度学习模型;S33、模型训练优化;在步骤S33中,使用交叉熵损失函数和随机梯度下降优化算法,对模型通过前向传播、计算损失、反向传播、参数更新以及多次迭代对模型进行优化;S34、模型评估:使用测试集的图像数据,评估训练好的模型在新数据上的识别准确率和性能;S35、训练好的模型对图片中的贻贝细胞进行自动识别并赋予识别框和类别,以准确标定每个细胞的位置和类别信息;S36、在算法内增加计数功能,使其在识别贻贝细胞的同时进行自动计数;S37、统计结果生成:根据计数结果生成相应的统计报告,包括贻贝细胞数量、密度信息。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 浙江大学海南研究院 基于深度学习的海洋贻贝微核细胞识别与计数方法及应用

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