龙图腾网&IPTOP
- 微信扫码登录
- 账号密码登录
- 短信登录/注册
买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！
申请/专利权人：安徽农业大学
摘要：本发明提供了一种基于全基因组DNA甲基化和转录组联合分析筛选梨果实石细胞发育差异基因的方法：S1、提取“石细胞含量高”和“石细胞含量低”的两个梨品种果实总DNA和总RNA；S2、DNA甲基化检测与转录组测序；S3、对DNA甲基化测序结果分析，筛选具有差异甲基化区DMR的基因；对转录组测序结果分析，筛选差异表达基因DEG；联合分析，筛选出表达量和DNA甲基化同时存在差异的基因；GO富集和KEGG富集分析。本发明能够通过融合DNA甲基化组数据和转录组数据挖掘目标基因，实现明联合分析甲基组数据和转录组数据，具有更全面的数据结果解释，为深入了解梨的遗传调控网络，为梨分子育种提供新的思路和策略。
主权项：1.一种基于全基因组DNA甲基化和转录组联合分析筛选梨果实石细胞发育差异基因的方法，其特征在于，包括如下步骤：S1、提取梨果实总DNA、总RNA分别提取“石细胞含量高”和“石细胞含量低”两个梨品种的梨果实总DNA，并进行总DNA样品检测；同时，提取两个梨品种的梨果实总RNA；S2、DNA甲基化检测与转录组测序①DNA甲基化检测：分别对提取的两个梨品种的梨果实总DNA进行全基因组甲基测序；超声处理基因组DNA片段化至200～300bp，然后进行末端修复和腺苷酸化；使用甲基化试剂盒处理DNA片段若干次；对制备的文库进行测序，并进行碱基检测；②转录组测序：分别对提取的两个梨品种的梨果实总RNA进行反转录生成相应的cDNA文库，并进行测序；同时，采用qRT-PCR对各文库有效浓度进行定量，保证文库质量；S3、生物信息学分析对DNA甲基化测序结果进行分析，并利用统计模型区分甲基化信号和背景变异信号，筛选出具有甲基化信号的胞嘧啶位点；根据具有甲基化信号的胞嘧啶位点和差异甲基化位点的阈值，确定差异甲基化位点；进而筛选出两个梨品种中“具有差异甲基化区DMR的基因”；对转录组测序结果进行转录组分析，筛选出两个梨品种“差异表达基因DEG”；进行DNA甲基化组与转录组的联合分析，筛选出“表达量和DNA甲基化同时存在差异的基因”；对联合分析筛选的差异基因进行GO富集分析和KEGG富集分析。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 安徽农业大学 一种基于全基因组DNA甲基化和转录组联合分析筛选梨果实石细胞发育差异基因的方法
免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。
主营中国专利交易买卖与专利转让许可,高校科技成果推广与科技成果转化,知识产权运营管理与平台开发,科技人才专家库与科技猎头等科技服务
开放平台
担保交易
惠及多方
会员特惠
专属平台
适合多方
数据共享
功能齐全
皖公网安备 34010402703815号