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摘要:本发明公开了基于反转录转座子序列的黄精IRAP标记序列、试剂盒及用途,包括通过筛选出的17条IRAP标记引物进行黄精种质鉴定。鉴定方法包括提取基因组DNA、基于黄精反转录转座子Ty1‑copia和Ty3‑gypsy的RT序列设计IRAP引物、选取不同种质的DNA对IRAP引物按照PCR反应体系和PCR反应程序进行PCR反应扩增、凝胶电泳筛选及多态性分析等步骤。本发明基于黄精反转录转座子序列开发IRAP标记,该标记操作方便、快速、结果稳定、效率高、不易受环境影响,可运用于各地区黄精种质鉴定、遗传多样性评价、物种亲缘关系分析等研究,为优异种质挖掘、辅助育种及种质产权保护提供有效手段。
主权项:1.一种用于黄精种质鉴定的反转录转座子序列的IRAP标记引物,其特征在于,所述IRAP标记引物包括如下列出的一条或多条特异性引物:引物PsRT-5,序列为5’-GTAAGATCCATGTGTGTACTACAAGC-3’;引物PsRT-7,序列为5’-GAAGTTTGAGAACTTCATGGAGGA-3’;引物PsRT-14,序列为5’-AAGGTATGCAGACTTCGGAAAT-3’;引物PsRT-15,序列为5’-GATCCATGTGTTTACTTACACAAGC-3’;引物PsRT-16,序列为5’-GTCCGTATGATCCATGTGTTTACT-3’;引物PsRT-21,序列为5’-TCTACATGCACCAACCAGTGG-3’;引物PsRT-24,序列为5’-GGCTGCAGGTAAAGAAAAATTGG-3’;引物PsRT-37,序列为5’-GAGGAGGAGACCTACATGACTC-3’;引物PsRT-38,序列为5’-GGCTGCAGGCAAAGAAAAAAT-3’;引物PsRT-39,序列为5’-TCTTCACGACAATGGTACAAGAG-3’;引物REPs-1,序列为5’-GCGGGTGTCTTCTCAAAGT-3’;引物REPs-16,序列为5’-GGATAGACGATTTGTTTGACCAGT-3’;引物REPs-17,序列为5’-AAGTATCCGTTGCCCAGAATC-3’;引物REPs-34,序列为5’-GGAGCGAGTGTCTTCTCAAA-3’;引物REPs-40,序列为5’-CCGAGAATCGACGATCTGTT-3’;引物REPs-43,序列为5’-GTTATCACCTGCTGCGTGT-3’;引物REPs-45,序列为5’-GAACAAGGTTACCATCCGAAAC-3’。
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百度查询: 贵州大学 基于反转录转座子序列的黄精IRAP标记序列、试剂盒及用途
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