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一种基于化学空间的定量筛选新药先导物的方法 

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摘要:本发明公开了一种基于化学空间的定量筛选新药先导物的方法,包括:通过不同数据库,得到具有特定功效的中药化学成分数据,并获取中药化学成分数据的CanonicalSMILES编码;基于ChEMBL数据库,得到具有IC50值的化合物集合并作为背景数据;将中药化学成分数据和化合物集合混合后,计算所有分子的FCFP_6指纹并根据Tanimoto距离进行聚类计算,将结构相似的背景数据和中药化学成分数据划入同一化学空间;构建广义线性模型,基于同一化学空间,通过广义线性模型定量预测中药化学成分的IC50值;将IC50值与已上市药物相比,筛选出开发新药的先导物。本发明能够更准确的定量预测出中药成分的IC50值。

主权项:1.一种基于化学空间的定量筛选新药先导物的方法,其特征在于,包括以下步骤:基于中医药系统的不同数据库,得到具有特定功效的中药化学成分数据,并获取中药化学成分数据的CanonicalSMILES编码;基于ChEMBL数据库,得到具有IC50值的化合物集合并作为背景数据,并获取所述化合物的CanonicalSMILES编码;将所述中药化学成分数据和所述化合物集合混合后,计算所有分子的FCFP_6指纹并根据Tanimoto距离进行聚类计算,将结构相似的背景数据和中药化学成分数据划入同一化学空间;构建广义线性模型,基于同一化学空间,通过所述广义线性模型定量预测所述中药化学成分的IC50值;将所述IC50值与已上市药物相比,筛选出开发新药的先导物。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国中医科学院中医临床基础医学研究所 一种基于化学空间的定量筛选新药先导物的方法

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