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一种基于微生物组数据的生存风险预测方法、装置及设备 

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申请/专利权人:云南大学

摘要:本发明涉及神经网络预测技术领域,公开了一种基于微生物组数据的生存风险预测方法、装置、设备及存储介质。该方法包括:获取三种不同类型的癌症患者的临床数据和原始微生物学数据;根据临床数据为原始微生物学数据制作分类标签;将原始微生物学数据输入已训练好的变分自编码器模型中,得到从潜在空间中解码出来的对应重建微生物数据;将原始微生物学数据与对应的重建微生物数据相加,得到增强数据表达;对增强数据表达进行映射处理,得到固定维度的向量空间数据;将向量空间数据输入已训练的生存风险预测模型,输出预测结果。本发明方法能够大幅度减轻原始微生物学数据高维度、低样本量特点导致的模型过拟合问题,提升模型性能以及预测的精准度。

主权项:1.一种基于微生物组数据的生存风险预测方法,其特征在于,包括步骤:获取三种不同类型的癌症患者的临床数据和原始微生物学数据,其中,三种不同类型的癌症分别是指皮肤鳞状细胞黑色素瘤、肺鳞状细胞癌和肾透明细胞癌;根据临床数据为所述癌症患者的原始微生物学数据制作对应的分类标签,所述分类标签包括长期生存和短期生存;将所述原始微生物学数据输入已训练好的变分自编码器模型中,得到从潜在空间中解码出来的对应重建微生物数据;将所述原始微生物学数据与对应的重建微生物数据相加,得到增强数据表达;对所述增强数据表达进行映射处理,得到固定维度的向量空间数据;将所述向量空间数据输入已训练的生存风险预测模型,输出预测结果。

全文数据:

权利要求:

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