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基于大数据的毒素-抗毒素同源性鉴定方法及设备 

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申请/专利权人:南方医科大学

摘要:本发明实施例涉及一种基于大数据的毒素‑抗毒素同源性鉴定方法及设备。该方法包括:基于预设数据库对测序数据经基因组拼接得到的草图基因组序列进行同源性检索,输出初始比对结果;对所述初始比对结果进行结果过滤、整合和优化,输出同源物;对携带TA的草图基因组序列进行整合元件注释、可移动基因元件和抗生素抗性基因注释;将所述同源物作为参考序列,通过同源性检索在群体数据中进行同源基因鉴定,对每类同源物在群体中进行统计归纳。本发明实施例的技术方案可得到较为完整的可靠的同源物,降低用户解读成本。

主权项:1.一种基于大数据的毒素-抗毒素同源性鉴定方法,其特征在于,包括:基于预设数据库对测序数据经基因组拼接得到的草图基因组序列进行同源性检索,输出初始比对结果;对所述初始比对结果进行结果过滤、整合和优化,输出同源物;对携带TA的草图基因组序列进行整合元件注释、可移动基因元件和抗生素抗性基因注释;将所述同源物作为参考序列,通过同源性检索在群体数据中进行同源基因鉴定,对每类同源物在群体中进行统计归纳。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 南方医科大学 基于大数据的毒素-抗毒素同源性鉴定方法及设备

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