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一种基因测序数据质量评估方法、系统、设备及存储介质 

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申请/专利权人:四川大学华西医院

摘要:本发明公开了一种基因测序数据质量评估方法、系统、设备及存储介质,其中方法包括步骤:根据基因测序样本数据进行样本集制作;将样本集中的数据进行归一化处理,并形成训练集和测试集;构建测序数据质量评估模型;采用训练集对构建的测序数据质量评估模型进行训练,并采用测试集对训练后的测序数据质量评估模型进行测试,获得训练完成的测序数据质量评估模型;将获取的基因测序数据输入训练完成的测序数据质量评估模型进行质量评估,输出质量评估结果。其显著效果是:能够有效识别样本污染、样本讲解、样本混杂等异常情况,对于具有不同协方差结构的数据,质量评估的性能和准确性更高且具有普适性。

主权项:1.一种基因测序数据质量评估方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤1、样本集制作:根据基因测序样本数据进行样本集制作;步骤2、样本集处理:将样本集中的数据进行归一化处理,并随机提取数据形成训练集和测试集;步骤3、模型构建:构建测序数据质量评估模型;步骤4、模型训练:采用训练集对构建的测序数据质量评估模型进行训练,并采用测试集对训练后的测序数据质量评估模型进行测试,获得训练完成的测序数据质量评估模型;步骤5、数据质量评估:将获取的基因测序数据输入训练完成的测序数据质量评估模型,并基于期望最大化算法进行质量评估,输出质量评估结果。

全文数据:

权利要求:

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