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一种飞行时间质谱峰检测方法 

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申请/专利权人:浙江迪谱诊断技术有限公司

摘要:本发明公开了一种飞行时间质谱峰检测方法,包括:步骤1:获取整条核酸质谱数据,将整条核酸质谱数据按照间隔长度num进行分段;步骤2:求解得到各采样点的一阶导数数据;步骤3:对步骤2得到的一阶导数数据进行降噪光顺处理,得到光顺后的核酸质谱数据;步骤4:向下寻找过零点的一阶导数值,并对光顺后的核酸质谱数据进行分段,依据各分段内的离子强度阈值Ithreshold和二阶导数阈值I″threshold,对过零点的一阶导数值以及其对应的核酸质谱数据进行筛选,筛选出侯选峰;步骤5:采用信噪比SNR阈值对侯选峰做进一步筛选,确定目标峰。

主权项:1.一种飞行时间质谱峰检测方法,其特征在于:包括以下步骤:步骤1:获取整条核酸质谱数据,对于第i个采样点i∈{1,2,3,…,n},该采样点对应的核酸质谱数据表示为Ii,mzi,其中,Ii为离子强度,mzi为离子质荷比;将整条核酸质谱数据按照间隔长度num进行分段;步骤2:求解得到各采样点的一阶导数数据,其中,对于第i个采样点i∈{1,2,3,…,n},该采样点对应的一阶导数数据表示为I′i,mzi;步骤3:对步骤2得到的一阶导数数据进行降噪光顺处理,得到光顺后的核酸质谱数据,其中,第i个采样点i∈{1,2,3,…,n},该采样点对应的光顺后的核酸质谱数据表示为Si,mzi;步骤4:向下寻找过零点的一阶导数值,并对光顺后的核酸质谱数据进行分段,依据各分段内的离子强度阈值Ithreshold和二阶导数阈值I″threshold,对过零点的一阶导数值以及其对应的核酸质谱数据进行筛选,筛选出侯选峰;步骤5:采用信噪比SNR阈值对侯选峰做进一步筛选,确定目标峰;步骤4中,对于第j个分段,其强度阈值表示为Ithresholdj,由下式计算得到: 式中,为第j分段内离子强度的平均值,σj为第j分段内离子强度的标准差;c为信号强度阈值系数;二阶导数阈值表示为I″thresholdj,由下式计算得到: 式中,d为特定系数,Hj和Wj为第j分段内峰高最小的特征峰的峰高和半高半宽;步骤4中,所述的依据离子强度阈值Ithreshold和二阶导数阈值I″threshold,对该过零点的一阶导数值以及其对应的核酸质谱数据进行筛选,筛选出侯选峰;具体操作包括:记筛选出来的侯选峰表示为Iij,mzij,其对应的一阶导数值为I′ij,该一阶导数值为过零点的一阶导数值,且该侯选峰Iij,mzij符合以下条件: 式中,表示第j分段的强度阈值,为第j分段的二阶导数阈值,I′i+1j为第j分段内第i+1采样点的离子强度Ii+1j的一阶导数I′i+1j。

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