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脂质分子的粗粒化模拟方法、装置及计算机程序产品 

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申请/专利权人:北京剂泰医药科技有限公司;杭州剂泰医药科技有限责任公司

摘要:本申请涉及一种脂质分子的粗粒化模拟方法、装置及计算机程序产品。该方法包括:获取目标脂质分子的分子信息;根据分子信息中的基团进行片段划分,获得对应的目标片段组合;将目标片段组合中的各基团分别与各类预设珠子进行匹配,获得多种候选粗粒化模型;获取目标脂质分子的全原子模型形成脂质双层膜后的全原子模拟轨迹,及分别获取各候选粗粒化模型形成脂质双层膜后对应的粗粒化模拟轨迹;分别根据全原子模拟轨迹和粗粒化模拟轨迹中的对应的预设描述符,在各候选粗粒化模型中筛选获得目标粗粒化模型。本申请提供的方案,能够自动、准确且高效地生成脂质分子的粗粒化模型,提高模型的生成效率。

主权项:1.一种脂质分子的粗粒化模拟方法,其特征在于,包括:获取目标脂质分子的分子信息;根据所述分子信息中的基团进行片段划分,获得对应的目标片段组合;将所述目标片段组合中的各基团分别与各类预设珠子进行匹配,获得多种候选粗粒化模型;获取目标脂质分子的全原子模型形成脂质双层膜后的全原子模拟轨迹,及分别获取各所述候选粗粒化模型形成脂质双层膜后对应的粗粒化模拟轨迹;分别根据所述全原子模拟轨迹和所述粗粒化模拟轨迹中的对应的预设描述符,在各所述候选粗粒化模型中筛选获得目标粗粒化模型;其中,根据所述全原子模拟轨迹,获取对应的第一平均脂质面积;根据各所述粗粒化模拟轨迹,分别获取对应的第二平均脂质面积;分别计算第一平均脂质面积与各第二平均脂质面积的差值,将所述差值最小的候选粗粒化模型作为目标粗粒化模型。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 北京剂泰医药科技有限公司 杭州剂泰医药科技有限责任公司 脂质分子的粗粒化模拟方法、装置及计算机程序产品

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