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申请/专利权人：赣南医学院
摘要：本申请涉及一种胆道闭锁潜在分子亚型及其核心基因的识别方法，基于样本内基因间相对表达秩次关系，挖掘潜在的具有亚型识别能力的基因对，再通过聚类分析识别分子亚型并验证，然后利用加权基因共表达网络分析识别BA亚型相关的基因模块筛选亚型相关的核心基因。摆脱了基因表达绝对值的限制，克服了不同实验室间表达值不可比的弱点，最大程度地消除了群体差异对结果造成的影响，且通过这种方法识别的胆道闭锁亚型关键基因可以应用于单个个体样本。
主权项：1.一种胆道闭锁潜在分子亚型及其核心基因的识别方法，其特征在于，所述方法包括：步骤A：从基因表达综合数据库获取胆道闭锁组织表达谱数据，对所述表达谱数据进行预处理，得到包含正常组织样本、疾病组织样本的背景基因；步骤B，包括步骤B1、步骤B2、步骤B3和步骤B4：步骤B1：将正常组织样本中的基因两两组合，根据公式1，满足PGiGj≥0.9，的基因对为稳定基因对， 其中n表示所有的正常样本数，t代表第t个样本，GiGj表示基因i和基因j的表达水平大小关系；步骤B2：基于所述稳定基因对在疾病组织样本中相对表达秩次关系的改变情况，筛选疾病组织样本中的逆转基因对；步骤B3：基于所述逆转基因对在疾病样本中的相对表达秩次关系，将所述逆转基因对分成两组，根据两组基因对间的表达基因的差异以及生物学功能扰动情况，筛选出具有潜在疾病分子亚型鉴别能力的基因对；步骤B4：根据所述具有潜在疾病分子亚型鉴别能力的基因对识别疾病分子亚型；步骤C：基于加权基因共表达网络提取所述疾病分子亚型相关的基因模块作为候选模块；步骤D：对所述候选模块内的基因进行蛋白与蛋白之间的互作分析以及核心基因筛选。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 赣南医学院 一种胆道闭锁潜在分子亚型及其核心基因的识别方法
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