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申请/专利权人:浙江大学医学院附属第一医院
摘要:本发明提供一种检测猴痘病毒及其亚型的多重荧光定量PCR试剂盒,所述猴痘病毒包括猴痘病毒、猴痘‑西非株、和猴痘‑刚果盆地株和RNaseP及其亚型。本发明分别根据猴痘病毒的高度保守的核苷酸序列分别设计高特异性的引物探针,从而可通过一个PCR反应从血液分泌物样本中同时检测出是否有猴痘病毒及其区分其亚型猴痘‑西非株和猴痘‑刚果盆地株的存在,较单重荧光定量PCR方法更简便快捷、成本低,且敏感性和特异性及重复性均较好。对待检病毒进行全封闭检测、单管扩增实时定量,根据病毒感染的拷贝数,可有效、快速地筛查猴痘病毒及其亚型。本发明可应用于猴痘病毒及其亚型的快速筛查和鉴定及猴痘病毒的流行病学研究。
主权项:1.一种检测猴痘病毒及其亚型的多重荧光定量PCR试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包含定量PCR反应液、酶混合液、引物与探针混合液、标准品、阳性对照品、阴性对照品;其中定量PCR反应液包含有PCR反应缓冲液、酶混合液,引物与探针混合液包含四组引物和相应的四种不同荧光标记的探针;荧光定量PCR检测用猴痘病毒、猴痘-西非株、猴痘-刚果盆地株和核糖核酸酶的上游引物和下游引物及相应的特异性探针序列如下:上游引物MPXV-F:5’-GTCAGCAGTGGCGATTTTCT-3’下游引物MPXV-R:5’-TGAACCAGATGGTCCTCTCAATA-3’特异性探针MPXV-P:5’-FAM-TAATAAACACCCACGTAAATACAAAACAGA-BHQ1-3’上游引物MPXVWA-F:5’-ATATCACTACGGACATAAACCATTGT-3’下游引物MPXVWA-R:5-ACGTCGATGTCAGAAATAATCAAC-3’特异性探针MPXVWA-P:5’-ROX-TAAGTTCCTGGATCGGATGTCACCGC-BHQ2-3’上游引物MPXVCB-F:5’-GATATAGGTGTCTTCATAACGCATT-3’下游引物MPXVCB-R:5’-GCGTGAATATCTAAAGATTATGGG-3’特异性探针MPXVCB-P:5’-CY5-TCTCAAATACATGATAGGATAATAGAATGCTAA-BHQ3-3’上游引物RNaseP-F:5’-AGATTTGGACCTGCGAGCG-3’下游引物RNaseP-R:5’-GAGCGGCTGTCTCCACAAGT-3’特异性探针RNaseP-P:5’-VIC-TTCTGACCTGAAGGCTCTGCGCG-BHQ1-3’所述标准品包括MPXV、MPXVWA、MPXVCB和RNaseP的保守区基因序列的质粒:猴痘病毒标准品其保守区基因序列为:ATATTTGGTATTACCACATTAATTATATTGTCAGCAGTGGCGATTTTCTGTATTACGTATTATATATGTAATAAACACCCACGTAAATACAAAACAGAGAACAAAGTCTAGATTTTGACTTACATAAATATCTGGGATAATAAAATCTATCATATTGAGAGGACCATCTGGTTCAGGAAAGACAGCCATAACCAAAAGA猴痘-西非株标准品其保守区基因序列为:GATTAAATATTTTAATAGTATCCATTTTATATCACTACGGACATAAACCATTGTATATTTTTTATGTTTATTAGTGTACACATTTTGGAAGTAAGTTCCTGGATCGGATGTCACCGCAGTAATAATGTTGATTATTTCTGACATCGACGTATTATATAGTTTTTTAATTCCATATCTTT猴痘-刚果盆地株标准品其保守区基因序列为:TCTTGATACTTTTTCTAGAAAAAAAATTGAATTGATGATATAGGTGTCTTCATAACGCATTATTACGTTAGCATTCTATTATCCTATCATGTATTTGAGAGTCTTATATGTAGCAAACATGATAACTGCAATACCCATAATCTTTAGATATTCACGCGTGCTATGGATGGCATTATCCCGCGGTRNaseP标准品其保守区基因序列为:ATGGGACTTCAGCATGGCGGTGTTTGCAGATTTGGACCTGCGAGCGGGTTCTGACCTGAAGGCTCTGCGCGGACTTGTGGAGACAGCCGCTCACCTTGGCTATTCAGTTGTTGCTATC。
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