买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！

申请/专利权人：大连医科大学

摘要：本发明公开一种基于PageRank算法、MCC算法和网络药理学分析知柏地黄丸治疗糖尿病肾病的核心活性成分和作用机理的方法，其通过筛选知柏地黄丸活性成分并收集活性成分对应靶点信息、收集疾病相关靶点、获取药物‑疾病交集基因、构建蛋白质相互作用网络、GO及KEGG通路富集分析等步骤，确定知柏地黄丸治疗糖尿病肾病等主要靶点及核心药物活性成分，并对知柏地黄丸治疗糖尿病肾病的作用机制进行研究。本发明为知柏地黄丸治疗糖尿病肾病提供了科学的理论基础，同时为知柏地黄丸对糖尿病肾病的临床治疗和科学研究提供了新的方法。

主权项：1.一种基于PageRank算法、MCC算法和网络药理学确定知柏地黄丸治疗糖尿病肾病的核心活性成分和作用机理的方法，其特征在于，其包括如下步骤：S1：筛选知柏地黄丸药物活性成分及作用靶点：在BATMAN-TCM2.0数据库中检索“熟地黄”、“知母”、“黄柏”、“山茱萸”、“山药”、“牡丹皮”、“茯苓”和“泽泻”的化学成分并进行活性成分筛选，获得知柏地黄丸活性成分信息和相关靶点信息；S2：获取糖尿病肾病相关靶点：在DrugBank、DisGeNET、GeneCards、OMIM数据库和TTD数据库中检索糖尿病肾病相关靶点并保存；S3：获取药物-疾病共同靶点对所述药物活性成分作用靶点和所述糖尿病肾病的潜在靶点取交集，得到交集靶点并作Venn图；S4：构建蛋白质相互作用网络：将药物-疾病共同靶点输入STRING数据库，进行蛋白质-蛋白质相互作用protein-proteininteraction,PPI网络分析，下载并保存tsv文件进行进一步分析。S5：构建“药物-成分-靶点”网络：根据PPI网络中的靶点对药物活性成分作用靶点进行筛选，并通过Cytoscape3.9.1软件构建“药物-成分-靶点”网络，将药物、活性成分、作用靶点的关系可视化，得到“药物-成分-靶点”网络图；S6：GO及KEGG通路富集分析：利用Metascape数据库，对PPI网络中的靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析；S7：筛选蛋白质相互作用网络中的核心靶点：首先，应用PageRank算法对PPI网络中的药物靶点进行打分，并取排名前20的药物靶点；其次，将STRING数据库导出的tsv文件导入到Cytoscape3.9.1软件中，然后应用cytoHubba插件，通过MCC算法进行排序整理，从PPI网络中筛选排名前20的药物靶点；最后，取两种算法所确定的核心药物靶点的交集，即为知柏地黄丸治疗糖尿病肾病的核心靶点；S8：确定知柏地黄丸治疗糖尿病肾病的核心活性成分：通过步骤S7确定知柏地黄丸治疗糖尿病肾病的核心靶点，与之作用的药物成分即为知柏地黄丸治疗糖尿病肾病的核心活性成分。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 大连医科大学 一种基于PageRank算法、MCC算法和网络药理学分析知柏地黄丸治疗糖尿病肾病的核心活性成分和作用机理的方法